More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0305 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
382 aa  759    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.65 
 
 
354 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  39.64 
 
 
341 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  35.71 
 
 
345 aa  186  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  36.42 
 
 
346 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  38.18 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  40.24 
 
 
362 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.26 
 
 
353 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  36.55 
 
 
375 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  37.69 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  35.31 
 
 
344 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  32.24 
 
 
376 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  32.23 
 
 
398 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  35.87 
 
 
307 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  39.77 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  40.94 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  42.11 
 
 
263 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  28.57 
 
 
286 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.95 
 
 
384 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.88 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.43 
 
 
364 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  28.96 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  32.02 
 
 
388 aa  110  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  31.85 
 
 
370 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  36.9 
 
 
246 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  33.16 
 
 
374 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.53 
 
 
269 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0253  protein of unknown function DUF182  28.44 
 
 
337 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0507983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  34.22 
 
 
282 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  30.25 
 
 
386 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  25.67 
 
 
339 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  31.2 
 
 
385 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  29.53 
 
 
366 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  28.09 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  27.43 
 
 
372 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  33.04 
 
 
381 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  27.11 
 
 
400 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  34.67 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  34.12 
 
 
250 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  31.79 
 
 
526 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  28.97 
 
 
368 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  31.81 
 
 
370 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  30.95 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  30.19 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  27.95 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  34.29 
 
 
279 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  31.37 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  33.53 
 
 
244 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  26.98 
 
 
379 aa  96.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  33.13 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  30 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04230  hypothetical protein  38.41 
 
 
328 aa  95.1  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  30.46 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.39 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  29.24 
 
 
356 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.74 
 
 
336 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  29.86 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  28.83 
 
 
332 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  29.58 
 
 
339 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0727  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  35.53 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.666329  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  29.53 
 
 
343 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.64 
 
 
233 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  28.57 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.98 
 
 
233 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.29 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  34.92 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  37.27 
 
 
338 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  28.82 
 
 
330 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.33 
 
 
266 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  30.49 
 
 
342 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  28.23 
 
 
306 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  28.82 
 
 
338 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  28.53 
 
 
306 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32 
 
 
235 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  26.16 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  29.51 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  26.82 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  34.1 
 
 
230 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  28.82 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.22 
 
 
240 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  28.74 
 
 
278 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  33.33 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.05 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  29.88 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  28.45 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  30.58 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  27.92 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  25.07 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.13 
 
 
541 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  33.13 
 
 
541 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  33.13 
 
 
541 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.13 
 
 
541 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.13 
 
 
541 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  25.8 
 
 
337 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.13 
 
 
541 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  33.13 
 
 
541 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  26.35 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  33.13 
 
 
541 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  32.18 
 
 
233 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.09 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>