195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1376 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  718    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  35.96 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  40.52 
 
 
345 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.79 
 
 
346 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.27 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  34.08 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  25 
 
 
295 aa  119  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  28.93 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0492  hypothetical protein  33.2 
 
 
256 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0503  hypothetical protein  33.2 
 
 
256 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0481  hypothetical protein  33.2 
 
 
256 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3028  protein of unknown function DUF182  34.36 
 
 
255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2092  hypothetical protein  30.86 
 
 
256 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1215  protein of unknown function DUF182  33.81 
 
 
270 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516897  normal  0.921927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10377  hypothetical protein  29.74 
 
 
251 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000697611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1752  carbon monoxide dehydrogenase, coxF accessory protein  35.09 
 
 
271 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.348042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  27.21 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  26.77 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  27.97 
 
 
526 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1567  hypothetical protein  28.36 
 
 
297 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00460262  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  28.72 
 
 
271 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02708  conserved protein with NAD(P)-binding Rossman fold  26.94 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0817  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  26.94 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  27.37 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3035  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.94 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02670  hypothetical protein  26.94 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3008  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.94 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0833  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein  26.94 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3200  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.2 
 
 
541 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4165  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.57 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  25.48 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  28.65 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  28.33 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  23.57 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  28.47 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  27.8 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  27.63 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.34 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  24.5 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  27.93 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  29.34 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  24.26 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  27.07 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  26.09 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  25.18 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  32.72 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  24.73 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0253  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.94 
 
 
260 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0909345  normal  0.275043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  29.94 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  24.44 
 
 
386 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  24.44 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  24.44 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  22.68 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28.22 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  28.9 
 
 
483 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  25.71 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  24.34 
 
 
244 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  22.85 
 
 
345 aa  59.7  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  25.26 
 
 
354 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0679  protein of unknown function DUF182  25 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.350419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  28.24 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  30 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  23.37 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  25.48 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  21.4 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2834  protein of unknown function DUF182  26.28 
 
 
253 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  24.14 
 
 
376 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  30.77 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  28.85 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  28.85 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  29.63 
 
 
381 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  25.83 
 
 
282 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  23.49 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  27.65 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1324  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.17 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.996684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  29.41 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  27.98 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  29.52 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  27.92 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0674  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.48 
 
 
186 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  30.97 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  24.63 
 
 
374 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  31.13 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  28.31 
 
 
373 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  27.27 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  25.77 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  22.85 
 
 
248 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  29.27 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  31.01 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  23.55 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2005  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33 
 
 
109 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0215568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  25.1 
 
 
368 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  31.01 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  25.62 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
973 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  31.01 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  31.01 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01780  hypothetical protein  23.12 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  31.65 
 
 
453 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  25.87 
 
 
364 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>