167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3884 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  93.09 
 
 		 188 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  81.07 
 
 		 196 aa  289  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  83.12 
 
 		 205 aa  278  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  84.97 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  84.97 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  84.97 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  81.65 
 
 		 220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  81.65 
 
 		 220 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  82.24 
 
 		 211 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  63.8 
 
 		 330 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  60.44 
 
 		 342 aa  221  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  63.25 
 
 		 331 aa  220  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  61.63 
 
 		 344 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  62.72 
 
 		 344 aa  217  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  59.09 
 
 		 343 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  52.38 
 
 		 338 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  56.21 
 
 		 339 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  52.73 
 
 		 334 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  52.73 
 
 		 682 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  52.73 
 
 		 682 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  57.42 
 
 		 336 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  51.52 
 
 		 334 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  55.84 
 
 		 336 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  57.55 
 
 		 340 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  56.83 
 
 		 340 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  56.83 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.83 
 
 		 381 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.83 
 
 		 381 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.83 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.83 
 
 		 381 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  51.72 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  52.41 
 
 		 279 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  53.25 
 
 		 334 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  53.64 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  48.97 
 
 		 285 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  51.72 
 
 		 279 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  49.66 
 
 		 281 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  49.66 
 
 		 281 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  49.66 
 
 		 281 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  51.72 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  48.97 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.97 
 
 		 281 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  54.55 
 
 		 336 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  48.97 
 
 		 280 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.03 
 
 		 470 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  46.05 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.11 
 
 		 294 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.03 
 
 		 278 aa  138  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.99 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  46.31 
 
 		 289 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  44.97 
 
 		 327 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  44.74 
 
 		 290 aa  134  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.95 
 
 		 341 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  44.59 
 
 		 295 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  43.95 
 
 		 274 aa  124  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  43.51 
 
 		 278 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.31 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  36.11 
 
 		 313 aa  117  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  42.38 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  39.49 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  43.12 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.95 
 
 		 285 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  41.18 
 
 		 283 aa  111  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  39.33 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.33 
 
 		 288 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  41.78 
 
 		 271 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.94 
 
 		 283 aa  104  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.79 
 
 		 337 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  44.14 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.1 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  101  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.76 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.71 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  44 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.41 
 
 		 271 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  38.67 
 
 		 313 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  38.67 
 
 		 313 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  36.42 
 
 		 248 aa  88.6  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.09 
 
 		 267 aa  88.2  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  32.07 
 
 		 286 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  35.76 
 
 		 313 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  32.46 
 
 		 328 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  35.9 
 
 		 256 aa  84.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  36.42 
 
 		 320 aa  84.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.98 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.54 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  34.71 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.71 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  28.48 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  26.22 
 
 		 277 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  28.29 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.87 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  30.34 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  30.07 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  31.13 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.68 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  31.67 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  28.21 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  29.11 
 
 		 354 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>