211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01780  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  672    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0727  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  67.48 
 
 
329 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.666329  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04230  hypothetical protein  61.16 
 
 
328 aa  424  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0865  hypothetical protein  32.69 
 
 
375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000040151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  39.07 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  42.31 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.75 
 
 
353 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38 
 
 
384 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  39.31 
 
 
341 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  36 
 
 
265 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  35.37 
 
 
281 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  39.47 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  36.97 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  34.87 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.73 
 
 
354 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  34.9 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.78 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  34.73 
 
 
398 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  36.18 
 
 
376 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  34.54 
 
 
344 aa  89.4  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  33.96 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  35.06 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  34.01 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.17 
 
 
240 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  34.48 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  31.9 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.29 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1381  protein of unknown function DUF182  32.88 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  31.29 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3936  selenium-dependent molybdenum hydroxylase system protein, YqeB family  24.91 
 
 
526 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  30.77 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  32.88 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  32.24 
 
 
385 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  32.69 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.5 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  28.14 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  31.82 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.43 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  27.51 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  27.51 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1734  hypothetical protein  34.46 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  28.92 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.1 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  32.89 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  32.43 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.41 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  30.92 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  30.43 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  32.92 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  27.27 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  30.85 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  32.26 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  33.77 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  34.23 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.33 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.34 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  29.73 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.08 
 
 
176 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.33 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  29.68 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  31.82 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.56 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  28.93 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  29.25 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  29.03 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  32.52 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  30 
 
 
425 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  31.08 
 
 
323 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  26.23 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  30.87 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  29.93 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.29 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  26.7 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  32.89 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  30.26 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  32.3 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  31.21 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  26.26 
 
 
242 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.76 
 
 
242 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  32.92 
 
 
372 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  28 
 
 
374 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  28.38 
 
 
483 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  30.52 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  27.74 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  32.21 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  27.5 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  31.54 
 
 
233 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.01 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  30.87 
 
 
233 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.37 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  25.32 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  28.14 
 
 
421 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  28.92 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  30.2 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  29.25 
 
 
379 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  31.65 
 
 
402 aa  59.3  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  28.76 
 
 
402 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  29.2 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1569  hypothetical protein  28.83 
 
 
271 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>