228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3436 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  49.55 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  49.25 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  49.25 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  48.96 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  48.07 
 
 		 341 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  48.52 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  48.22 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  45.78 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.22 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  46.27 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  47.04 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  46.89 
 
 		 365 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  44.61 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  43.15 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  38.02 
 
 		 348 aa  222  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38.33 
 
 		 347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.21 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  34.12 
 
 		 334 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  30.12 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.91 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.14 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.28 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  33.03 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  28.81 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  28.42 
 
 		 385 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  29.29 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.01 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  31.02 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  27.64 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  28.07 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  31.49 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30.86 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  30.9 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  31.43 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  26.93 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  27.25 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  28.45 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  25.27 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  25.21 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  26.61 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  27.3 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.55 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.3 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.3 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  29.57 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  26.63 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  26.65 
 
 		 453 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  25.42 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  24.19 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  25.31 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  24.13 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  27.78 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  24.92 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  27.72 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  25.31 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  29.19 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  25.44 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  27.15 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  27.81 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  26.36 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  26.36 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  28.06 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  26.32 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.52 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  26.4 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  27.66 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  26.71 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  24.69 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  26.24 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  25.52 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  25.62 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  24.68 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  25.39 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  26.14 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  23.06 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  22.67 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  28.03 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  24 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  25.57 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  23.89 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  26.15 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  27.89 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  28.03 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  27.64 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  26.15 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  24.7 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  28.66 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  24.62 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  26.48 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>