216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1412 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  56.97 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  56.97 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  56.38 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  56.38 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  55.49 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  56.94 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  55.49 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  55.49 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  54.9 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.39 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  50.15 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  47.95 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  47.53 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  45.78 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38.01 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  39.59 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  33.43 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  38.11 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  30.97 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.02 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.49 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  31.3 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  30.84 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  27.89 
 
 		 385 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.7 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.79 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  29.78 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  28.57 
 
 		 400 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  27.06 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  26.32 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  28.71 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  26.72 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  26.8 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  26.59 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  25.21 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  26.45 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  27.21 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  24.28 
 
 		 449 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  23.7 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  24.51 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  25.96 
 
 		 316 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  26.13 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  24.92 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  26.44 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  24.77 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  25.41 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  24.68 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  25.41 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  25.15 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  25.41 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  22.65 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  25.41 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  26.3 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  25.84 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  25.58 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  24.53 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  23.73 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  24.76 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  24.76 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  24.42 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  23.19 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  24.76 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  25.98 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  24.03 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  24.79 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  24.79 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  24.79 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  25.15 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  22.36 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  23.99 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  24.44 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  22.36 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  22.36 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  23.78 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  22.36 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  22.73 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  22.73 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  23.51 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  24.59 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  22.25 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  25.16 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  23.46 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  23.62 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  23.79 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  23.51 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  26.46 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  24.92 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  22.01 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  22.88 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  23.82 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  24.53 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  24.36 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  25.54 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  24.18 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  22.96 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  22.67 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  23.08 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  21.7 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>