269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2513 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  716    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  45.01 
 
 		 347 aa  301  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  40.06 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.94 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  37.14 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  39.71 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  37.18 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  37.46 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  37.14 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  37.46 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  37.14 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  37.43 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  36.9 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  38.02 
 
 		 347 aa  222  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  36.69 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  33.43 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  35.14 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  38.35 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  37.32 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  32.49 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.53 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  30.35 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  32.08 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.57 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  30.64 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  30.42 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  29.32 
 
 		 385 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  29.5 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  31.73 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  33.04 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  31.23 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  32.31 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  28.3 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  27.46 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  28.66 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  28.48 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  26.96 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  29.94 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  29.14 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  27.65 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  23.6 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  28.02 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  26.78 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  28.93 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  26.06 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  28.78 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  27.86 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  29.65 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  25.14 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  27.86 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  29.15 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.15 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.15 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  29.24 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  27.25 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  26.75 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.78 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  25.15 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  29.36 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  29.36 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  27.95 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  28.39 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  28.86 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  28.05 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  26.07 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  25.28 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  28.78 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.24 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  23.84 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  28.65 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  27.83 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  28.15 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  28.86 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  29.18 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  26.48 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  29.91 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  25.48 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  24.47 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  25.41 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  28.27 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  26.04 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  27.54 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  27.54 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  27.54 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  28.12 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  26.32 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  26.3 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  25.43 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  26.52 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  26.42 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  27.25 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  26.87 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  26.83 
 
 		 325 aa  93.6  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  26.96 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  26.96 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  23.85 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  25.93 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  25.27 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>