258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0280 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 		 347 aa  711    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  45.01 
 
 		 348 aa  301  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  43.99 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  39.43 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  37.57 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.42 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.83 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  37.43 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  37.13 
 
 		 338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  38.44 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  37.13 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  37.24 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  37.13 
 
 		 338 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  38.78 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  36.95 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  38.33 
 
 		 347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  38.11 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  36.68 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  37.18 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.13 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  31.4 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  29.46 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  27.79 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  28.73 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  30.75 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  28.49 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  30.39 
 
 		 382 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  27.75 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.21 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  26.08 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  27.13 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  25.78 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  28.33 
 
 		 370 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  25.49 
 
 		 395 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  28.26 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  27.96 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  27.33 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  24.7 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  25.35 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  24.87 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  28.06 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  26.11 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  24.46 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  27 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  26.67 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  23.86 
 
 		 386 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  23.86 
 
 		 386 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  23.86 
 
 		 386 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  23.67 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  37.04 
 
 		 449 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  25.72 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  24.92 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  22.69 
 
 		 385 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  21.82 
 
 		 386 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  24.57 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  28.3 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  22.43 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  26.06 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  27.63 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  22.4 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  23.82 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  21.37 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  26.64 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  21.18 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  24.26 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  27.99 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  26.06 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  20.82 
 
 		 397 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  24 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  24.46 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  20.67 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  22.54 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  24.67 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  25.47 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  21.17 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  24.92 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  26.06 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  26.03 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  25.95 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  24.38 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  24.38 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  24.35 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  23.81 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  24.09 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  22.29 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  26.47 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  26.98 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  25.95 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  25.95 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  25.95 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  26.52 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  24.69 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  21.9 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  24.92 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  26.2 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  24.4 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  26.18 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>