262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2711 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  685    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  40.06 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  39.64 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  39.82 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  39.94 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.57 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  39.94 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  39.94 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  38.32 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  37.46 
 
 		 341 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  39.59 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  37.54 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.44 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  37.65 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  37.95 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.22 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  34.24 
 
 		 365 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  35.67 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  34.12 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  31.2 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  32.15 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.77 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.3 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  31.58 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.88 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  30 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  26.41 
 
 		 440 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.79 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  27.55 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  30.14 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  26.1 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  28.57 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  31.53 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  31.45 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  30.87 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  26.69 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  27.09 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29.9 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.4 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  28.7 
 
 		 339 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  26.09 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.4 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  26.74 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  28.15 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  28.99 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  28.06 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  27.67 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  28.31 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  27.95 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  27.95 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  26.9 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  27.64 
 
 		 340 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  26.02 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  26.08 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  27.48 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  25.13 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  25.35 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  26.06 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  26.32 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  27.1 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  24.87 
 
 		 386 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  24.87 
 
 		 386 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  25.21 
 
 		 367 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  24.07 
 
 		 425 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  28.22 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  28.97 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  23.99 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  23.77 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  24.16 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  25.97 
 
 		 306 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  27.63 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  26.3 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  25.79 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  26.17 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  23.51 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  27.73 
 
 		 350 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  28.17 
 
 		 327 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  24.4 
 
 		 385 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  23.51 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  28.99 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  26.27 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  27.24 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  29.03 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  29.18 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  25.4 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  24.87 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  25.87 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  26.89 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  23.93 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  26.13 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  27.02 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  25.87 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  25.51 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  25.97 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>