229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01057 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  100 
 
 		 330 aa  687    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  37.94 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  39.1 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  38.01 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.42 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  36.22 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  37.05 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  35.93 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  36.5 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  36.76 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  36.2 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  35.63 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  35.99 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  35.99 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  35.57 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  36.39 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  34.94 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  35.21 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  33.98 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  30.24 
 
 		 389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  27.78 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  29.57 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  29.68 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  27.54 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  29.67 
 
 		 402 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.57 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  27.22 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  27.03 
 
 		 400 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  27.79 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  28.96 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  27.04 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  27.36 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  26.44 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  27.36 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  27.04 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  26.25 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  26.44 
 
 		 372 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  28.53 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  26.44 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  25.55 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  27.72 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  23.23 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  26.42 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  24.85 
 
 		 388 aa  89.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  26.42 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  26.63 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  24.08 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  24.79 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.77 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  29.37 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  26.8 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  24.75 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.21 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  24.55 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  26.76 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  25.97 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.63 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  25.39 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  26 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  26.79 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  27.1 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  26.69 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  26.71 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  26.71 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  25.29 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  25.84 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.63 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  25.7 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  26.22 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  23.28 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  24.71 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  24.71 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  24.71 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  24.4 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  24.4 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  24.4 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  24.45 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  26.71 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  25 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  24.14 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  26.47 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  24.4 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  26.16 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  25.67 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  24.56 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  25.3 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  24.3 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  24.1 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  24.56 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  33.96 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  26.11 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  24.12 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  25.79 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  23.69 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  24.63 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  26.84 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>