251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1834 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  100 
 
 		 330 aa  685    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  52.55 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  49.44 
 
 		 365 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  51.96 
 
 		 338 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  51.96 
 
 		 338 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  51.66 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  51.21 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  50.15 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  52.57 
 
 		 337 aa  335  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  52.28 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  51.98 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  51.81 
 
 		 338 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  51.67 
 
 		 337 aa  332  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  49.7 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  44.61 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  43.99 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  39.64 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  39.1 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  39.71 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  32.23 
 
 		 400 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.88 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  32.48 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  33.06 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.12 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.55 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  30.99 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  31.25 
 
 		 382 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  29.66 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  29.19 
 
 		 395 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.45 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  27.45 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  29.48 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.91 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  27.67 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  28.2 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  27.38 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  25.44 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  26.58 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  26.89 
 
 		 449 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  27.38 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.2 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  26.59 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  27.67 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  26.73 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 453 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.04 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  26.91 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  26.91 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  26.91 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  26.33 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  27.39 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  27.39 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.04 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  27.14 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  26.1 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  26.1 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  27.07 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  26.69 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  25.71 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  26.38 
 
 		 398 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  25.77 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  26.79 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  22.55 
 
 		 369 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  24.77 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  26.22 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  26.51 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  24.53 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  24.3 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  27.13 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  25.54 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  26.73 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  24.3 
 
 		 385 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  26.38 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  22.28 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  22.69 
 
 		 386 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  25.4 
 
 		 343 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  25.4 
 
 		 343 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  26.42 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  27.83 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  25.16 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  28.4 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  25.39 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  26.09 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  24.62 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  24.7 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  26.15 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  25.85 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  24.93 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  25.9 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  25.56 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  26.65 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  24.33 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  24.47 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  24.33 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  24.33 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  22.47 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  27.67 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  23.55 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>