219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1627 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  98.82 
 
 
338 aa  683    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
338 aa  689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  98.52 
 
 
338 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  98.82 
 
 
338 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  83.38 
 
 
338 aa  587  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  77.74 
 
 
337 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  77.74 
 
 
337 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  76.56 
 
 
337 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  76.26 
 
 
337 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  56.38 
 
 
338 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  56.3 
 
 
341 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  51.96 
 
 
330 aa  341  9e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  52.71 
 
 
349 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  50 
 
 
365 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  49.25 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  39.82 
 
 
334 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  37.18 
 
 
348 aa  225  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.43 
 
 
347 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.93 
 
 
330 aa  210  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  35.45 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  33.44 
 
 
389 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  31.04 
 
 
379 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.19 
 
 
372 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30.86 
 
 
400 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  28.4 
 
 
385 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.52 
 
 
402 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  30.02 
 
 
440 aa  123  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  27.68 
 
 
341 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  28.82 
 
 
386 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  31.95 
 
 
382 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  31.92 
 
 
395 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.87 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  31.65 
 
 
370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  31.7 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  27.25 
 
 
449 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  28.66 
 
 
365 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  28.12 
 
 
395 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  27.36 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  28.85 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  28.19 
 
 
374 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.43 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  26.49 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  27 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  28.57 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  27.11 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  28.07 
 
 
373 aa  92.8  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  26.53 
 
 
453 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.82 
 
 
341 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.82 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  26.92 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  25.79 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  26.24 
 
 
343 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  26.24 
 
 
343 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  28.13 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  26.07 
 
 
315 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.2 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  27.2 
 
 
373 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  28.35 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  27.55 
 
 
398 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  27.22 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  27.22 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  27.22 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  26.5 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  29.26 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  27.52 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  29.15 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  27.25 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  27.52 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  30.31 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  26.3 
 
 
386 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  26.3 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  26.3 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  27.14 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  29.15 
 
 
362 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  28.44 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  27.25 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  26.77 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  27.52 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  26.96 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  25.23 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  26.8 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  28.06 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  27 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  26.67 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  26.67 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  26.09 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  27.48 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  26.18 
 
 
366 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  25.57 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  25.56 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  28.26 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  24.39 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  26.72 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  24.93 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  27.88 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  26.46 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  24.93 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  27.42 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  24.93 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  27.22 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>