240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1010 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  906    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  54.74 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  40.82 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  38.61 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  37.29 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  30.39 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  31.34 
 
 		 395 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.51 
 
 		 372 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  32.27 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  31.57 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  29.16 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  29.78 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  28.3 
 
 		 348 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.13 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  26.41 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  30.02 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  27.14 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  30.26 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  30.02 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  30.02 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  28.39 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  29.54 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  30.02 
 
 		 338 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  28.4 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  26.91 
 
 		 332 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.09 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  28.14 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  27.47 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  27.45 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  27.64 
 
 		 347 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  27.29 
 
 		 337 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  26.81 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  27.06 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  28.06 
 
 		 349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  27.11 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  26.33 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  27.67 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  26.79 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  27.16 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  26.79 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  26.74 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  26.65 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  25.62 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  25.62 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  25.62 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  27.46 
 
 		 385 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  25.98 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  26.68 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  26.97 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  26.1 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  27.13 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  27.41 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  26.11 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  30.05 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  24.94 
 
 		 351 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  23.83 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  33.73 
 
 		 244 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  24.38 
 
 		 385 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.13 
 
 		 248 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  25.45 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  25.51 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  27.53 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  25.76 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  25.3 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  22.78 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  26.15 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  23.64 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  24.03 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  29.7 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  26.85 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  22.97 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  27.11 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  25.21 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  26.7 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  29.11 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  25.76 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  22.22 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  24.09 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  29.27 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  29.27 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  23.57 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  31.55 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  33.33 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  27.16 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  25 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  32.92 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  28 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  23.93 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  27.71 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.91 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  26.38 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0362  protein of unknown function DUF182  25.44 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00300908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  30.43 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  31.71 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  26.95 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.77 
 
 		 250 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28.93 
 
 		 240 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  25.15 
 
 		 281 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  20.47 
 
 		 354 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  29.63 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>