226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2226 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  56.94 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  51.45 
 
 		 341 aa  346  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  52.71 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  52.71 
 
 		 338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  52.42 
 
 		 338 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  52.42 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  50.28 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  50.81 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  52.59 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  51.87 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  51.4 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  51.4 
 
 		 337 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  49.7 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  43.15 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  38.35 
 
 		 348 aa  215  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.57 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.18 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  35.67 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  33.33 
 
 		 389 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.64 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  32.67 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  29.4 
 
 		 379 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  29.03 
 
 		 400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.22 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  28.96 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  27.64 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  31.2 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  28.06 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  28.19 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  29.15 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  29.89 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.82 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  31.14 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  25.93 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.61 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  28.61 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.06 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 385 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  28.3 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  28.61 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  26.93 
 
 		 369 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  26.53 
 
 		 340 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  28.11 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  27.19 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 453 aa  89.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  27.27 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  25.95 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  27.68 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  28.48 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  24.93 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  25.97 
 
 		 345 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  27.36 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  27.73 
 
 		 316 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.43 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  26.24 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  25.83 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  24.56 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  27.79 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  26.87 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  27.79 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  26.87 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  26.87 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  28.06 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  27.58 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  28.12 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  24.93 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  27.23 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  26.12 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  27.14 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  27.22 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  25.48 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  25.6 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  25.6 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  25.21 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  26.26 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  26.69 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  26.18 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  25.38 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  25.07 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  23.89 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  28.53 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  28.53 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  28.53 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  27.22 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  25.22 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  24.47 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  25.35 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  24.71 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  28.24 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  25.3 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  26.3 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  25.3 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  26.75 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>