214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1437 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  98.81 
 
 		 337 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  87.83 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  87.24 
 
 		 337 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  78.93 
 
 		 338 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  77.74 
 
 		 338 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  78.04 
 
 		 338 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  77.74 
 
 		 338 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  77.15 
 
 		 338 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  55.49 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  54.55 
 
 		 341 aa  358  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  51.67 
 
 		 330 aa  332  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  49.73 
 
 		 365 aa  328  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  51.4 
 
 		 349 aa  328  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  48.22 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  37.14 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.95 
 
 		 347 aa  215  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  37.65 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.99 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  33.94 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.14 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  32.45 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  31.1 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.96 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  28.08 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.9 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  30.33 
 
 		 382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  31.75 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  26.81 
 
 		 440 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  29.94 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  27.91 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  26.75 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  28.65 
 
 		 395 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  27.82 
 
 		 449 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  28.14 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  27 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  27.47 
 
 		 340 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  27.95 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.48 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  29.17 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  28.85 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  27.47 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  28.34 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  27.76 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  28.44 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  28 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 453 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  27.88 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  28.1 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  27.88 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  28.1 
 
 		 341 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  27.88 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  47.19 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  25.51 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  25.32 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  25.89 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  27.27 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  26.77 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  27.01 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  27.04 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  27.1 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  27.07 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  27.07 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  26.23 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  26.04 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  27.71 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  25.8 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  27.16 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  25.71 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  27.07 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  25.64 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  27.57 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  27.27 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  26.45 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  26.65 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  26.87 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0061  hypothetical protein  28.16 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  23.48 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  27.46 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  25.49 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  25.23 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  25.94 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  26.02 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  24.39 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  25.24 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  25.78 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  26.65 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  25.07 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  24.84 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  24.34 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  23.78 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  29.82 
 
 		 225 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  24.86 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  24.55 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  25.71 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>