More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3047 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3099  ATP synthase SpaL  100 
 
 
431 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0585331  hitchhiker  0.00000194741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3016  ATP synthase SpaL  100 
 
 
431 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3204  ATP synthase SpaL  100 
 
 
431 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3084  ATP synthase SpaL  100 
 
 
431 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3047  ATP synthase SpaL  100 
 
 
431 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.227762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4146  ATP synthase SpaL  63.98 
 
 
430 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017873 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0183  ATP synthase SpaL  58.74 
 
 
430 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.998687  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1540  ATP synthase SpaL  58.96 
 
 
436 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.808357  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0744  ATP synthase SpaL  58.96 
 
 
436 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0582  ATP synthase SpaL  58.87 
 
 
435 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0806368  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2064  ATP synthase SpaL  58.96 
 
 
436 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.740053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0832  ATP synthase SpaL  59.1 
 
 
436 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0528407  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2171  ATP synthase SpaL  58.87 
 
 
435 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2083  ATP synthase SpaL  58.87 
 
 
435 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.697803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  45.35 
 
 
440 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  46.45 
 
 
439 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  45.33 
 
 
440 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  45.04 
 
 
440 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  45.26 
 
 
438 aa  348  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  45.26 
 
 
438 aa  348  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  46.12 
 
 
449 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  42.25 
 
 
437 aa  343  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  44.47 
 
 
442 aa  341  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.99 
 
 
461 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.99 
 
 
461 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.99 
 
 
458 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.99 
 
 
458 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.96 
 
 
462 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  44.76 
 
 
445 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  43.99 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  44.52 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  44.34 
 
 
442 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  44.52 
 
 
445 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  44.39 
 
 
439 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  42.35 
 
 
443 aa  330  3e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  42.18 
 
 
437 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  42.38 
 
 
442 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  43.41 
 
 
449 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  43.41 
 
 
443 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  44.61 
 
 
441 aa  323  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  43.41 
 
 
449 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  44.58 
 
 
442 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  44.84 
 
 
433 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  44.82 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  44.04 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  44.9 
 
 
442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  44.9 
 
 
442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  44.66 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  44.9 
 
 
442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  44.9 
 
 
429 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  42.93 
 
 
436 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  44.58 
 
 
433 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  44.66 
 
 
463 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  44.58 
 
 
433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  44.58 
 
 
433 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  42.65 
 
 
429 aa  319  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  41.4 
 
 
427 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  43.44 
 
 
442 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  44.58 
 
 
443 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  41.06 
 
 
443 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  40.82 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  40.53 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  40.93 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  43.41 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  42.49 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  41.41 
 
 
454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  39.95 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  39.63 
 
 
434 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  42.79 
 
 
433 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  41.46 
 
 
426 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  41.39 
 
 
441 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  40.19 
 
 
437 aa  310  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  42.06 
 
 
466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  40.44 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  40.79 
 
 
487 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  41.61 
 
 
432 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  40.92 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  41.36 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  41.56 
 
 
480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  43.17 
 
 
435 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  45.2 
 
 
434 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  42.93 
 
 
435 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  41.57 
 
 
442 aa  301  1e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.77 
 
 
459 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2208  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  42.18 
 
 
455 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  40.29 
 
 
422 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.98 
 
 
449 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  41.75 
 
 
435 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  41.44 
 
 
448 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  40.23 
 
 
472 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  40 
 
 
434 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5207  ATPase, FliI/YscN family  43.46 
 
 
442 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  41.26 
 
 
450 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  40 
 
 
434 aa  295  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.22 
 
 
449 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  40.77 
 
 
443 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.57 
 
 
474 aa  293  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  40.33 
 
 
460 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  43.01 
 
 
444 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  41.2 
 
 
451 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>