More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0183 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0183  ATP synthase SpaL  100 
 
 		 430 aa  875    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.998687  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3204  ATP synthase SpaL  58.74 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3099  ATP synthase SpaL  58.74 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0585331  hitchhiker  0.00000194741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3047  ATP synthase SpaL  58.74 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.227762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3016  ATP synthase SpaL  58.74 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3084  ATP synthase SpaL  58.74 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4146  ATP synthase SpaL  56.71 
 
 		 430 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0832  ATP synthase SpaL  53.04 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0528407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1540  ATP synthase SpaL  52.34 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.808357  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2171  ATP synthase SpaL  52.46 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0582  ATP synthase SpaL  52.46 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0806368  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0744  ATP synthase SpaL  52.34 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2064  ATP synthase SpaL  52.34 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.740053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2083  ATP synthase SpaL  52.22 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.697803  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  45.99 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  47.84 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  45.61 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  43.63 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  47.59 
 
 		 449 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  44.94 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  45.39 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  44.61 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  42.72 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  44.07 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  43.63 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  44.81 
 
 		 433 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  44.81 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  44.81 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  47.4 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  47.4 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  47.4 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  47.4 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  47.4 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  47.14 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  44.81 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  47.14 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  44.81 
 
 		 443 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  42.55 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  42.37 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  43.86 
 
 		 463 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  42.79 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  43.86 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  43.3 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  42.55 
 
 		 445 aa  319  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  47.25 
 
 		 449 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  47.25 
 
 		 443 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  47 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  41.16 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  42.65 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  44.66 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.72 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.47 
 
 		 462 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  42.93 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.47 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.47 
 
 		 461 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  43.63 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  42.62 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  43.47 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.47 
 
 		 461 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  41.06 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  39.77 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  41.48 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  42.45 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.12 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  42.21 
 
 		 432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  41.02 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  41.32 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  42.54 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  39.72 
 
 		 443 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  42.3 
 
 		 441 aa  305  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  41.26 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  41.2 
 
 		 443 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  42.09 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  42.09 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.25 
 
 		 442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  41.02 
 
 		 434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  41.81 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  45.38 
 
 		 443 aa  303  6.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  41.39 
 
 		 466 aa  303  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  40.14 
 
 		 480 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  41.32 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  41.46 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  42.12 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  41.87 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  42.21 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  39.95 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  40.91 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2208  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.52 
 
 		 455 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  41.15 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  39.95 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  38.64 
 
 		 487 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  40.49 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  41.4 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  42.13 
 
 		 459 aa  296  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  41.73 
 
 		 436 aa  296  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  42.68 
 
 		 446 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  42.04 
 
 		 547 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  42.93 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  40.78 
 
 		 439 aa  292  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  41.96 
 
 		 450 aa  292  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>