More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0244 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0244  Type I secretion system ATPase, PrtD  100 
 
 		 592 aa  1169    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  46.98 
 
 		 577 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  47.54 
 
 		 600 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  46.8 
 
 		 582 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  46.8 
 
 		 582 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  47 
 
 		 614 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  44.07 
 
 		 582 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  44.61 
 
 		 581 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  44.05 
 
 		 583 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  44.54 
 
 		 582 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.23 
 
 		 667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  43.37 
 
 		 589 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  43.81 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  42.76 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  46.94 
 
 		 598 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.14 
 
 		 593 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  43.01 
 
 		 603 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.07 
 
 		 583 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  40.88 
 
 		 592 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  40.76 
 
 		 574 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  38.81 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  38.81 
 
 		 578 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  39.04 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  40.28 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1980  type I secretion system ATPase  40.11 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.43 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.93 
 
 		 596 aa  364  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.45 
 
 		 591 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.92 
 
 		 584 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  38.98 
 
 		 643 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  37.91 
 
 		 579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  37.5 
 
 		 580 aa  353  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  37.13 
 
 		 603 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  38.81 
 
 		 598 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  39.05 
 
 		 593 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  38.78 
 
 		 578 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  38.59 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.88 
 
 		 598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  38.96 
 
 		 578 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  37.15 
 
 		 588 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.52 
 
 		 570 aa  342  9e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  37.7 
 
 		 587 aa  339  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  37.99 
 
 		 593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  39.07 
 
 		 580 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  36.97 
 
 		 587 aa  336  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  36.5 
 
 		 574 aa  335  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.46 
 
 		 595 aa  333  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  38.06 
 
 		 587 aa  332  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  34.33 
 
 		 583 aa  332  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 		 599 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.62 
 
 		 587 aa  330  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  37.66 
 
 		 588 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  35.32 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  36.14 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  37.84 
 
 		 587 aa  327  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  36.31 
 
 		 572 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  37.03 
 
 		 591 aa  323  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.62 
 
 		 574 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  38.14 
 
 		 575 aa  321  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  33.04 
 
 		 581 aa  319  7.999999999999999e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  35.3 
 
 		 589 aa  319  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.44 
 
 		 560 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  35.6 
 
 		 573 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.05 
 
 		 585 aa  316  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  37.18 
 
 		 575 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  35.57 
 
 		 577 aa  313  4.999999999999999e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  36.14 
 
 		 569 aa  312  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  36.25 
 
 		 573 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.83 
 
 		 582 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  35.42 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  35.7 
 
 		 582 aa  309  6.999999999999999e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  35.35 
 
 		 663 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  36.35 
 
 		 602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.17 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  35.32 
 
 		 602 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  33.63 
 
 		 592 aa  306  8.000000000000001e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  36.29 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  38.34 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  34.35 
 
 		 570 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  35.95 
 
 		 571 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  36.06 
 
 		 573 aa  302  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 566 aa  300  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  35.66 
 
 		 561 aa  300  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  39.38 
 
 		 575 aa  298  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  35.73 
 
 		 576 aa  293  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.44 
 
 		 563 aa  291  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  35.97 
 
 		 619 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  35.87 
 
 		 576 aa  286  5.999999999999999e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  37.75 
 
 		 595 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  34.64 
 
 		 668 aa  286  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  34.17 
 
 		 535 aa  286  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  33.51 
 
 		 591 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1348  Type I secretion system ATPase, PrtD  33.87 
 
 		 556 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.716552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  35.93 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  33.99 
 
 		 671 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  33.87 
 
 		 742 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  36.31 
 
 		 596 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  34 
 
 		 782 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  35.13 
 
 		 582 aa  280  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>