60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1552.2 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1552.2  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  220  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  86.67 
 
 		 603 aa  197  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  86.67 
 
 		 603 aa  196  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  86.67 
 
 		 603 aa  196  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  84.76 
 
 		 605 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  84.76 
 
 		 605 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  84.76 
 
 		 605 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  83.81 
 
 		 605 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  79.05 
 
 		 603 aa  184  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  65.71 
 
 		 601 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  67.62 
 
 		 624 aa  158  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  64.76 
 
 		 601 aa  157  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  63.81 
 
 		 608 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  68.57 
 
 		 598 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  61.9 
 
 		 598 aa  153  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  55.96 
 
 		 616 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  53.33 
 
 		 610 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  31.43 
 
 		 585 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  30.48 
 
 		 584 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  29.36 
 
 		 600 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  29.52 
 
 		 585 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  31.43 
 
 		 594 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  32.38 
 
 		 587 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  28.97 
 
 		 601 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  28.97 
 
 		 601 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  28.57 
 
 		 584 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  29.73 
 
 		 601 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  27.36 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  31.13 
 
 		 596 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  32 
 
 		 689 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  27.36 
 
 		 585 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  28.85 
 
 		 594 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  25.45 
 
 		 585 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  26.85 
 
 		 591 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  25.93 
 
 		 590 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  36.62 
 
 		 588 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  27.78 
 
 		 618 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  31.58 
 
 		 602 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  28.44 
 
 		 593 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  35.21 
 
 		 588 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  31.48 
 
 		 587 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  27.52 
 
 		 593 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  36.62 
 
 		 588 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1102  PDZ/DHR/GLGF  34.33 
 
 		 565 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0587047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  36.62 
 
 		 588 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  31.63 
 
 		 578 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  30 
 
 		 588 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3352  peptidase M61 domain protein  25 
 
 		 598 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  28.04 
 
 		 591 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  29.25 
 
 		 585 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  30.77 
 
 		 592 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  29.9 
 
 		 607 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  29.9 
 
 		 617 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  31.82 
 
 		 545 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  27.96 
 
 		 571 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  32.39 
 
 		 588 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  22.61 
 
 		 528 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  26.67 
 
 		 584 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  32.39 
 
 		 588 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  32.39 
 
 		 588 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>