More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2850 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1188  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  99.68 
 
 
628 aa  1243    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.2 
 
 
630 aa  647    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261396  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2627  polysaccharide biosynthesis protein CapD  85.51 
 
 
628 aa  1061    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2850  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
655 aa  1302    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  46.52 
 
 
646 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  44.16 
 
 
644 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  42.81 
 
 
646 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.98 
 
 
646 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.76 
 
 
653 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.8 
 
 
634 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.883555  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0577  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.27 
 
 
627 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155394  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  42.79 
 
 
670 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  43.26 
 
 
665 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.58 
 
 
646 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3033  polysaccharide biosynthesis protein, putative epimerase/dehydratase  43.35 
 
 
644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.34 
 
 
675 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.15 
 
 
655 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.52 
 
 
646 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.95 
 
 
649 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.08 
 
 
668 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.56 
 
 
642 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.89 
 
 
669 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.1 
 
 
646 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.22 
 
 
664 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.49 
 
 
670 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  44.86 
 
 
635 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.65 
 
 
664 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.44 
 
 
676 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.06 
 
 
671 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001764  nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase  40.41 
 
 
662 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1878  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.7 
 
 
622 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822308  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.51 
 
 
647 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0605  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.4 
 
 
666 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0935812  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  45.27 
 
 
684 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.85 
 
 
688 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  42.33 
 
 
621 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1416  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.59 
 
 
647 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1756  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  41.96 
 
 
664 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3636  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.65 
 
 
664 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.79 
 
 
659 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32823  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.28 
 
 
665 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0234353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30080  Polysaccharide biosynthesis protein  43.93 
 
 
765 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.819591  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0612  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.27 
 
 
650 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
664 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2723  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.07 
 
 
649 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08591  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  46.75 
 
 
626 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0779  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.63 
 
 
644 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3983  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.88 
 
 
643 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.99 
 
 
682 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.64 
 
 
655 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179961  normal  0.331186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0697  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.1 
 
 
622 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.2 
 
 
615 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.48 
 
 
647 aa  399  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3389  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 
630 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0510  epimerase/dehydratase, putative  42.03 
 
 
622 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.798384  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.44 
 
 
653 aa  395  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0514  putative epimerase/dehydratase  41.86 
 
 
622 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  39.35 
 
 
665 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3273  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.88 
 
 
628 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14131  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane-associated protein  42.71 
 
 
520 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0371  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.89 
 
 
604 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1306  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  36.28 
 
 
635 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.238436  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14281  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  39.3 
 
 
629 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.98 
 
 
646 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.11 
 
 
625 aa  352  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.15 
 
 
635 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.29 
 
 
644 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.66 
 
 
638 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.84 
 
 
626 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.57 
 
 
647 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  41.65 
 
 
656 aa  343  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42 
 
 
627 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  41.06 
 
 
649 aa  342  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.22 
 
 
612 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42 
 
 
627 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42 
 
 
627 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.13 
 
 
627 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.46 
 
 
651 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.31 
 
 
627 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.31 
 
 
630 aa  339  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.04 
 
 
614 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.13 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.44 
 
 
616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.18 
 
 
612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  40.22 
 
 
625 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.12 
 
 
628 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  46.28 
 
 
615 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  41.46 
 
 
637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.68 
 
 
647 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.46 
 
 
637 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  41.46 
 
 
637 aa  337  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  41.46 
 
 
637 aa  337  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  41.46 
 
 
637 aa  337  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.46 
 
 
637 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  41.46 
 
 
637 aa  337  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  40.71 
 
 
635 aa  334  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  38.91 
 
 
603 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.24 
 
 
612 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.43 
 
 
613 aa  332  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.31 
 
 
642 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>