More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0510 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0514  putative epimerase/dehydratase  99.52 
 
 
622 aa  1254    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0510  epimerase/dehydratase, putative  100 
 
 
622 aa  1260    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.798384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0697  polysaccharide biosynthesis protein CapD  86.82 
 
 
622 aa  1114    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0779  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.35 
 
 
644 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0577  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.01 
 
 
627 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155394  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 
675 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.16 
 
 
664 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.84 
 
 
669 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  42.66 
 
 
665 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  42.43 
 
 
670 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.86 
 
 
655 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179961  normal  0.331186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.56 
 
 
688 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.03 
 
 
646 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2723  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.32 
 
 
649 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.58 
 
 
676 aa  465  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.97 
 
 
670 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  41.1 
 
 
646 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1756  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  42.03 
 
 
664 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3636  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.72 
 
 
664 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.78 
 
 
655 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001764  nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase  40.32 
 
 
662 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000353165  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3033  polysaccharide biosynthesis protein, putative epimerase/dehydratase  41.01 
 
 
644 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.81 
 
 
653 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  43.23 
 
 
646 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  41.41 
 
 
684 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.98 
 
 
646 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3983  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.47 
 
 
643 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.95 
 
 
649 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.33 
 
 
682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.36 
 
 
647 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.65 
 
 
659 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32823  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.38 
 
 
615 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.86 
 
 
664 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.42 
 
 
646 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.16 
 
 
634 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.883555  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  41.71 
 
 
644 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  40 
 
 
635 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.21 
 
 
646 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1878  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.5 
 
 
622 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822308  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  41.44 
 
 
665 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42 
 
 
642 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.2 
 
 
653 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41 
 
 
671 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.11 
 
 
668 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3389  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.67 
 
 
630 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0605  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.32 
 
 
666 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0935812  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0371  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.17 
 
 
604 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 
647 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30080  Polysaccharide biosynthesis protein  41.21 
 
 
765 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.819591  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.82 
 
 
664 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1416  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.38 
 
 
647 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.3 
 
 
665 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0234353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  38.91 
 
 
621 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3273  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.84 
 
 
628 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08591  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  41.67 
 
 
626 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1188  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  42.03 
 
 
628 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0612  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.32 
 
 
650 aa  395  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2627  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.36 
 
 
628 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2850  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.18 
 
 
655 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.48 
 
 
647 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.13 
 
 
630 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.25 
 
 
647 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14281  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  35.47 
 
 
629 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.06 
 
 
644 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.27 
 
 
626 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  40.07 
 
 
615 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.97 
 
 
612 aa  360  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.99 
 
 
613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.78 
 
 
638 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1306  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  36.43 
 
 
635 aa  357  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.238436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.38 
 
 
612 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.14 
 
 
650 aa  356  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  37.12 
 
 
649 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.35 
 
 
612 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.55 
 
 
642 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.29 
 
 
646 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.95 
 
 
637 aa  351  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  38.99 
 
 
635 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  34.79 
 
 
604 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.17 
 
 
609 aa  349  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.27 
 
 
613 aa  349  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.65 
 
 
607 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  34.96 
 
 
603 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  40.38 
 
 
614 aa  348  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.81 
 
 
635 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.01 
 
 
614 aa  347  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.13 
 
 
656 aa  347  4e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.25 
 
 
617 aa  346  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.98 
 
 
648 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  36.54 
 
 
625 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  36.89 
 
 
637 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  36.54 
 
 
656 aa  342  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  36.89 
 
 
637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.89 
 
 
637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  35.92 
 
 
647 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  36.89 
 
 
637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.26 
 
 
629 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  36.89 
 
 
637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.89 
 
 
637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  36.89 
 
 
637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>