More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2559 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  100 
 
 		 907 aa  1810    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  42.11 
 
 		 839 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  41.23 
 
 		 897 aa  559  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  41.6 
 
 		 828 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  40.46 
 
 		 834 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  40.75 
 
 		 831 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  41.62 
 
 		 839 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  43.92 
 
 		 868 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  40.52 
 
 		 831 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  43.13 
 
 		 832 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  39.34 
 
 		 850 aa  538  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  40.9 
 
 		 834 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  40.96 
 
 		 843 aa  531  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  41.5 
 
 		 831 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  42.16 
 
 		 828 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  42.1 
 
 		 855 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  39.69 
 
 		 844 aa  525  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  40.07 
 
 		 833 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  39.78 
 
 		 833 aa  522  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  38.55 
 
 		 855 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  39.17 
 
 		 802 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  39.24 
 
 		 805 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  38.38 
 
 		 805 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  42.49 
 
 		 832 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  39.56 
 
 		 833 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  34.77 
 
 		 853 aa  497  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  39.17 
 
 		 804 aa  499  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  41.36 
 
 		 851 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  35.95 
 
 		 859 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  37.84 
 
 		 794 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  37.7 
 
 		 794 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  37.57 
 
 		 794 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  37.89 
 
 		 804 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  33.41 
 
 		 850 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  36.26 
 
 		 878 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  38.19 
 
 		 868 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  37.39 
 
 		 911 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  36.65 
 
 		 846 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  38.18 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  38.18 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  38.18 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  39.29 
 
 		 837 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  38.18 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  38.18 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  38.18 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  38.18 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  34.47 
 
 		 887 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  36.66 
 
 		 846 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  38.08 
 
 		 935 aa  442  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  36.61 
 
 		 845 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  36.66 
 
 		 867 aa  439  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  39.39 
 
 		 848 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  37.79 
 
 		 890 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  37.44 
 
 		 868 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  37.44 
 
 		 882 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  37.14 
 
 		 868 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  37.26 
 
 		 868 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  35.83 
 
 		 870 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  37.07 
 
 		 901 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  35.08 
 
 		 882 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  36.36 
 
 		 868 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  37.27 
 
 		 845 aa  425  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  36.36 
 
 		 868 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  35.67 
 
 		 895 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  34.75 
 
 		 842 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  36.36 
 
 		 868 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  35.57 
 
 		 871 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  32.96 
 
 		 870 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  36.71 
 
 		 835 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  34.47 
 
 		 884 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  34.5 
 
 		 857 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  34.39 
 
 		 871 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  32.77 
 
 		 877 aa  373  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  33.5 
 
 		 885 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  33.5 
 
 		 885 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  33.5 
 
 		 885 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  32.14 
 
 		 877 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  31.71 
 
 		 909 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  37.79 
 
 		 497 aa  291  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  32.78 
 
 		 501 aa  289  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  33.47 
 
 		 480 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  32.57 
 
 		 818 aa  285  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  32.85 
 
 		 480 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  33.2 
 
 		 477 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  35.2 
 
 		 476 aa  281  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  34.67 
 
 		 471 aa  280  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  35.81 
 
 		 469 aa  279  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  32.44 
 
 		 481 aa  279  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  34.09 
 
 		 488 aa  278  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  34.03 
 
 		 480 aa  278  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  35.26 
 
 		 476 aa  278  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  31.82 
 
 		 480 aa  277  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  35.16 
 
 		 469 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  32.92 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  31.5 
 
 		 469 aa  275  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  35.16 
 
 		 469 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  34.95 
 
 		 469 aa  274  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  32.85 
 
 		 482 aa  274  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  31.29 
 
 		 469 aa  273  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  33.83 
 
 		 489 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>