286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2248 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 857 aa  1655    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  34.57 
 
 		 907 aa  392  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  33.14 
 
 		 839 aa  356  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  35.18 
 
 		 831 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  34.91 
 
 		 831 aa  350  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  35.81 
 
 		 844 aa  350  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  33.22 
 
 		 843 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  34.01 
 
 		 828 aa  348  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  37.14 
 
 		 828 aa  347  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  32.42 
 
 		 834 aa  343  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  35.07 
 
 		 867 aa  342  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  34.75 
 
 		 846 aa  340  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  36.7 
 
 		 832 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  35.26 
 
 		 833 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  34.72 
 
 		 846 aa  337  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  36.83 
 
 		 832 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  30.3 
 
 		 897 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  34.89 
 
 		 833 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  35.37 
 
 		 833 aa  327  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  30.18 
 
 		 850 aa  323  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  33.68 
 
 		 855 aa  323  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  33.22 
 
 		 831 aa  323  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  37.76 
 
 		 837 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  35.13 
 
 		 845 aa  320  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  33.17 
 
 		 868 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  32.65 
 
 		 839 aa  317  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  33.38 
 
 		 855 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  32.68 
 
 		 842 aa  316  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  33.8 
 
 		 794 aa  313  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  30.6 
 
 		 834 aa  310  6.999999999999999e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  30.19 
 
 		 870 aa  309  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  30.89 
 
 		 878 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  34.1 
 
 		 851 aa  306  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  33.03 
 
 		 794 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  32.9 
 
 		 794 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  30.94 
 
 		 911 aa  303  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  32.83 
 
 		 868 aa  302  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  31.41 
 
 		 868 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  32.19 
 
 		 868 aa  300  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  31.79 
 
 		 868 aa  300  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  31.29 
 
 		 882 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  31.67 
 
 		 868 aa  299  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  31.67 
 
 		 868 aa  299  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  31.55 
 
 		 868 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  30.85 
 
 		 870 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  30.38 
 
 		 850 aa  296  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  29.73 
 
 		 853 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  31.07 
 
 		 887 aa  294  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  29.83 
 
 		 859 aa  294  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  31.73 
 
 		 898 aa  293  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  31.73 
 
 		 898 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  31.73 
 
 		 898 aa  293  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  31.73 
 
 		 898 aa  293  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  31.73 
 
 		 898 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  31.73 
 
 		 898 aa  293  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  31.73 
 
 		 898 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  30.56 
 
 		 804 aa  291  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  34.19 
 
 		 845 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  31.39 
 
 		 805 aa  287  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  31.03 
 
 		 805 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  32.1 
 
 		 935 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  30.22 
 
 		 802 aa  277  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  31.12 
 
 		 885 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  31.12 
 
 		 885 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  31.12 
 
 		 885 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  32.86 
 
 		 848 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  31.72 
 
 		 804 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  30.34 
 
 		 884 aa  271  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  31.07 
 
 		 871 aa  270  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  31.57 
 
 		 877 aa  263  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  33.42 
 
 		 835 aa  261  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  29.96 
 
 		 882 aa  261  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  31.37 
 
 		 877 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  29.6 
 
 		 890 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  31.1 
 
 		 895 aa  253  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  29.95 
 
 		 901 aa  253  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  29.83 
 
 		 871 aa  241  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  28.71 
 
 		 909 aa  230  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  31.75 
 
 		 818 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  33.77 
 
 		 480 aa  200  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  30.95 
 
 		 488 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  32.05 
 
 		 507 aa  192  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07520  hypothetical protein  30.7 
 
 		 737 aa  191  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  30.1 
 
 		 567 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  30.1 
 
 		 567 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  30.1 
 
 		 567 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  30 
 
 		 551 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  32.82 
 
 		 481 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  32.09 
 
 		 553 aa  183  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  29.7 
 
 		 606 aa  184  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  30.67 
 
 		 544 aa  183  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  29.78 
 
 		 519 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  29.59 
 
 		 469 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  31.06 
 
 		 476 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  30.18 
 
 		 477 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  30.74 
 
 		 476 aa  181  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  31.25 
 
 		 488 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  30.55 
 
 		 482 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  29.58 
 
 		 480 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  28.23 
 
 		 482 aa  178  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>