254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2552 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  51.33 
 
 		 935 aa  701    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  46.19 
 
 		 898 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  45.91 
 
 		 868 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  45.33 
 
 		 895 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  46.19 
 
 		 898 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  46.19 
 
 		 898 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  45.85 
 
 		 868 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  43.81 
 
 		 870 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  45.61 
 
 		 878 aa  700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  46.06 
 
 		 868 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  46.19 
 
 		 898 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  44.85 
 
 		 871 aa  660    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  47.99 
 
 		 901 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  44.73 
 
 		 887 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  45.31 
 
 		 882 aa  675    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  46.19 
 
 		 882 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  45.2 
 
 		 870 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  45.97 
 
 		 868 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  46.19 
 
 		 898 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  46.43 
 
 		 868 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  45.97 
 
 		 868 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  46.19 
 
 		 898 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  48.93 
 
 		 911 aa  739    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  45.97 
 
 		 868 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  100 
 
 		 890 aa  1766    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  46.19 
 
 		 898 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  43.11 
 
 		 839 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  43.63 
 
 		 832 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  43.06 
 
 		 832 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  42.71 
 
 		 828 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  43.29 
 
 		 828 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  38.18 
 
 		 834 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  40.87 
 
 		 831 aa  505  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  36.19 
 
 		 850 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  40.23 
 
 		 831 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  40 
 
 		 831 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  40.42 
 
 		 868 aa  485  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  38.85 
 
 		 834 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  40.66 
 
 		 833 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  37.71 
 
 		 907 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  39.02 
 
 		 833 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  36.77 
 
 		 855 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  34.4 
 
 		 853 aa  445  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  38.89 
 
 		 844 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  37.69 
 
 		 839 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  38.99 
 
 		 855 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  39.32 
 
 		 833 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  37.11 
 
 		 843 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  35.15 
 
 		 805 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  34.89 
 
 		 805 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  35.21 
 
 		 802 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  37.14 
 
 		 846 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  37.14 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  37.01 
 
 		 867 aa  416  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  32.2 
 
 		 850 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  35.7 
 
 		 794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  33.92 
 
 		 804 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  36.66 
 
 		 845 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  36.16 
 
 		 794 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  36.41 
 
 		 794 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  33.92 
 
 		 859 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  36.14 
 
 		 845 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  34.43 
 
 		 897 aa  399  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  38.13 
 
 		 837 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  36.34 
 
 		 848 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  34.47 
 
 		 804 aa  379  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  36.18 
 
 		 851 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  33.79 
 
 		 871 aa  372  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  31.6 
 
 		 884 aa  349  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  33 
 
 		 877 aa  344  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  31.03 
 
 		 885 aa  333  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  31.03 
 
 		 885 aa  333  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  30.92 
 
 		 885 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  31.1 
 
 		 877 aa  330  8e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  33.91 
 
 		 835 aa  328  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  32.7 
 
 		 842 aa  312  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  30.2 
 
 		 909 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  36.29 
 
 		 497 aa  280  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  33.74 
 
 		 481 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  34.09 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  34.46 
 
 		 520 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  37.39 
 
 		 539 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  35.48 
 
 		 470 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  35.32 
 
 		 526 aa  264  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  33.47 
 
 		 479 aa  264  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  33.4 
 
 		 477 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  29.78 
 
 		 857 aa  261  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  35.61 
 
 		 470 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  35.17 
 
 		 489 aa  260  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  32.85 
 
 		 489 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  32.85 
 
 		 470 aa  259  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  34.23 
 
 		 469 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  30.95 
 
 		 818 aa  258  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  34.23 
 
 		 469 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  34.23 
 
 		 469 aa  258  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  31.94 
 
 		 476 aa  257  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  33.06 
 
 		 472 aa  257  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  33.47 
 
 		 469 aa  257  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  33.06 
 
 		 469 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  31.73 
 
 		 476 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>