More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2613 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  57.72 
 
 		 804 aa  923    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 794 aa  1565    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  58.59 
 
 		 805 aa  924    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  99.5 
 
 		 794 aa  1558    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  47.82 
 
 		 855 aa  681    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  59.03 
 
 		 805 aa  920    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  52.64 
 
 		 804 aa  778    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  57.45 
 
 		 802 aa  906    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  91.42 
 
 		 794 aa  1413    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  42.86 
 
 		 834 aa  618  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  41.77 
 
 		 839 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  43.59 
 
 		 833 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  42.5 
 
 		 855 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  42.66 
 
 		 844 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  42.57 
 
 		 833 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  42.29 
 
 		 833 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  41.11 
 
 		 843 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  40.2 
 
 		 846 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  40.28 
 
 		 846 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  39.95 
 
 		 867 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  40.52 
 
 		 845 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  39.92 
 
 		 839 aa  490  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  40 
 
 		 837 aa  479  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  38.7 
 
 		 845 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  38.18 
 
 		 907 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  37.77 
 
 		 868 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  35.31 
 
 		 834 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  38.21 
 
 		 851 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  36.35 
 
 		 850 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  36.79 
 
 		 828 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  38.08 
 
 		 832 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  35.37 
 
 		 911 aa  422  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  38.02 
 
 		 832 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  35.55 
 
 		 831 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  35.16 
 
 		 831 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  34.04 
 
 		 897 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  37.37 
 
 		 828 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  32.64 
 
 		 853 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  35.56 
 
 		 878 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  32.43 
 
 		 870 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  35.6 
 
 		 868 aa  406  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  34.9 
 
 		 887 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  36.48 
 
 		 831 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  36.16 
 
 		 890 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  35.56 
 
 		 898 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  35.56 
 
 		 898 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  35.56 
 
 		 898 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  35.56 
 
 		 898 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  35.56 
 
 		 898 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  36.27 
 
 		 935 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  35.69 
 
 		 898 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  35.56 
 
 		 898 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  34.53 
 
 		 870 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  31.56 
 
 		 859 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  33.85 
 
 		 901 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  33.09 
 
 		 882 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  30.35 
 
 		 850 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  33.21 
 
 		 868 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  33.71 
 
 		 882 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  34.61 
 
 		 895 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  32.77 
 
 		 868 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  35.5 
 
 		 871 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  33.29 
 
 		 868 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  33.99 
 
 		 868 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  33.99 
 
 		 868 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  33.99 
 
 		 868 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  32.9 
 
 		 842 aa  356  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  34.18 
 
 		 848 aa  349  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  34.04 
 
 		 871 aa  345  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  35.42 
 
 		 835 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  33.42 
 
 		 885 aa  333  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  33.42 
 
 		 885 aa  333  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  33.42 
 
 		 885 aa  333  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  30.67 
 
 		 884 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  31.94 
 
 		 877 aa  319  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  32.82 
 
 		 877 aa  315  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  30.58 
 
 		 909 aa  302  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  33.38 
 
 		 857 aa  300  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  31.63 
 
 		 481 aa  274  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  34.97 
 
 		 497 aa  271  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  33.4 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  32.45 
 
 		 477 aa  268  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  33.4 
 
 		 470 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  31.47 
 
 		 470 aa  262  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  33.4 
 
 		 470 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  32.44 
 
 		 818 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  32.72 
 
 		 489 aa  258  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  30.06 
 
 		 486 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  32.36 
 
 		 494 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  31.43 
 
 		 484 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  32.85 
 
 		 471 aa  251  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  32.42 
 
 		 567 aa  251  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  32.42 
 
 		 567 aa  251  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  32.42 
 
 		 567 aa  251  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  32.62 
 
 		 469 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  32.12 
 
 		 469 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  31.26 
 
 		 553 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  31.32 
 
 		 469 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  29.92 
 
 		 487 aa  247  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  30.75 
 
 		 484 aa  247  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>