More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3406 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  52.84 
 
 		 868 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  53.54 
 
 		 898 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  48.93 
 
 		 890 aa  723    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  53.54 
 
 		 898 aa  816    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  53.54 
 
 		 898 aa  815    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  51.73 
 
 		 882 aa  822    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 911 aa  1823    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  53.54 
 
 		 898 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  51.15 
 
 		 868 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  45.54 
 
 		 878 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  53.54 
 
 		 898 aa  816    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  53.88 
 
 		 868 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  53.54 
 
 		 898 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  60.4 
 
 		 871 aa  1014    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  62.2 
 
 		 901 aa  1013    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  44.5 
 
 		 887 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  50.75 
 
 		 868 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  44.99 
 
 		 882 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  45.38 
 
 		 870 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  50.75 
 
 		 868 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  53.54 
 
 		 898 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  51.73 
 
 		 868 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  50.75 
 
 		 868 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  51.73 
 
 		 935 aa  798    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  55.35 
 
 		 870 aa  927    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  46.34 
 
 		 895 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  41.83 
 
 		 839 aa  598  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  43.34 
 
 		 828 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  41.96 
 
 		 828 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  42.02 
 
 		 831 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  43.28 
 
 		 832 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  42.02 
 
 		 831 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  39.88 
 
 		 850 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  42.16 
 
 		 831 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  38.56 
 
 		 834 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  41.8 
 
 		 832 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  43.26 
 
 		 868 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  38.86 
 
 		 844 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  38.04 
 
 		 834 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  39.01 
 
 		 833 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  38.01 
 
 		 855 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  38.51 
 
 		 833 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  38.08 
 
 		 833 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  38.33 
 
 		 855 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  37.3 
 
 		 843 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  36.82 
 
 		 839 aa  458  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  37.39 
 
 		 907 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  36.92 
 
 		 846 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  36.94 
 
 		 853 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  37.71 
 
 		 802 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  32.97 
 
 		 850 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  37.72 
 
 		 846 aa  445  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  37.6 
 
 		 867 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  36.84 
 
 		 805 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  36.21 
 
 		 805 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  34.38 
 
 		 859 aa  429  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  37.3 
 
 		 897 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  35.92 
 
 		 845 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  38.63 
 
 		 837 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  35.62 
 
 		 804 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  35.37 
 
 		 794 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  35.64 
 
 		 794 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  38.24 
 
 		 851 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  36.13 
 
 		 794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  35.09 
 
 		 845 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  37.89 
 
 		 848 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  35.39 
 
 		 804 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  34.99 
 
 		 871 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  34.86 
 
 		 842 aa  345  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  35.63 
 
 		 835 aa  335  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  31.66 
 
 		 885 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  31.67 
 
 		 885 aa  330  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  31.66 
 
 		 885 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  32.46 
 
 		 877 aa  323  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  30.69 
 
 		 884 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  31.48 
 
 		 877 aa  317  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  34.48 
 
 		 481 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  37.83 
 
 		 526 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  37.5 
 
 		 552 aa  299  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  35.08 
 
 		 544 aa  296  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  38.79 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  33.62 
 
 		 470 aa  294  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  34.86 
 
 		 519 aa  294  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  37.62 
 
 		 470 aa  294  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  33.27 
 
 		 479 aa  293  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  33.51 
 
 		 606 aa  292  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  35.29 
 
 		 567 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  35.29 
 
 		 567 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  35.29 
 
 		 567 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  34.21 
 
 		 480 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  33.82 
 
 		 480 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  34.11 
 
 		 489 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  32.07 
 
 		 857 aa  290  7e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  39.19 
 
 		 539 aa  289  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  35.62 
 
 		 489 aa  290  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  37.15 
 
 		 470 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  36.24 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  30.99 
 
 		 909 aa  288  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  34.27 
 
 		 479 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  36.45 
 
 		 469 aa  287  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>