More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5653 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  68.14 
 
 
831 aa  1078    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  67.66 
 
 
831 aa  1073    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  52.88 
 
 
839 aa  816    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  65.95 
 
 
831 aa  1004    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  69.27 
 
 
828 aa  1091    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  69.9 
 
 
828 aa  1065    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  91.11 
 
 
832 aa  1455    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  100 
 
 
832 aa  1627    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  49.45 
 
 
834 aa  711    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  46.06 
 
 
850 aa  689    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  47.19 
 
 
868 aa  628  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  42.1 
 
 
878 aa  572  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  40.32 
 
 
887 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  43.33 
 
 
890 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  42.46 
 
 
911 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  39.16 
 
 
870 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  42.6 
 
 
907 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  40.7 
 
 
901 aa  538  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  43.83 
 
 
935 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  42.41 
 
 
868 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  40.07 
 
 
870 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  41.7 
 
 
898 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  38.94 
 
 
859 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  41.7 
 
 
898 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  41.7 
 
 
898 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  41.7 
 
 
898 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  41.7 
 
 
898 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  41.7 
 
 
898 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  41.7 
 
 
898 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  42.4 
 
 
895 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  41.98 
 
 
834 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  40.87 
 
 
882 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  41.21 
 
 
868 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  39.03 
 
 
853 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  43.11 
 
 
855 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  40.63 
 
 
868 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  40.53 
 
 
868 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  41.12 
 
 
868 aa  499  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  39.42 
 
 
882 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  40.53 
 
 
868 aa  499  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  40.53 
 
 
868 aa  499  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  38.33 
 
 
897 aa  488  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  43.94 
 
 
851 aa  489  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  39.81 
 
 
871 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  42.13 
 
 
844 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  41.71 
 
 
839 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  42.06 
 
 
846 aa  475  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  40.46 
 
 
843 aa  475  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  41.46 
 
 
833 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  38.26 
 
 
805 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  34.82 
 
 
850 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  41.91 
 
 
846 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  41.78 
 
 
867 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  37.58 
 
 
805 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  37.92 
 
 
802 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  37.58 
 
 
804 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  40.51 
 
 
833 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  39.22 
 
 
855 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  40.53 
 
 
833 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  41.38 
 
 
845 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  38.2 
 
 
794 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  37.75 
 
 
794 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  38.33 
 
 
794 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  38.27 
 
 
845 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  38.1 
 
 
804 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  37.9 
 
 
877 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  36.9 
 
 
884 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  37.31 
 
 
877 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  37.75 
 
 
871 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  36.99 
 
 
885 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  36.99 
 
 
885 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  36.99 
 
 
885 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  41.73 
 
 
837 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  39.77 
 
 
835 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  37.27 
 
 
842 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  40.19 
 
 
848 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  36.94 
 
 
818 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  34.76 
 
 
909 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  36.89 
 
 
857 aa  346  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  38.96 
 
 
567 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  38.96 
 
 
567 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  38.96 
 
 
567 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  39.41 
 
 
477 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  40.89 
 
 
470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  38.48 
 
 
480 aa  337  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  38 
 
 
519 aa  334  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  39.24 
 
 
494 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  35.12 
 
 
481 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  39.58 
 
 
606 aa  332  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  39.66 
 
 
507 aa  332  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  37.83 
 
 
551 aa  331  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  38.98 
 
 
488 aa  331  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  40.25 
 
 
470 aa  332  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  37.23 
 
 
544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  37.26 
 
 
482 aa  328  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  39.24 
 
 
469 aa  327  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  39.24 
 
 
469 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  38.9 
 
 
469 aa  327  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  39.49 
 
 
488 aa  327  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  38.72 
 
 
497 aa  326  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>