More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0165 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  100 
 
 
848 aa  1627    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  51.23 
 
 
835 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  43.12 
 
 
871 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  39.53 
 
 
884 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  41.71 
 
 
885 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  41.72 
 
 
877 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  41.71 
 
 
885 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  41.71 
 
 
885 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  41.19 
 
 
877 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  36.72 
 
 
853 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  41.49 
 
 
851 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  38.51 
 
 
909 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  34.98 
 
 
859 aa  452  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  33.56 
 
 
850 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  39.53 
 
 
907 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  40.88 
 
 
818 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  36.83 
 
 
839 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  36.61 
 
 
834 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  33.92 
 
 
897 aa  415  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  39.41 
 
 
868 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  38.93 
 
 
828 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  35.01 
 
 
850 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  39.36 
 
 
828 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  36.74 
 
 
831 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  34.37 
 
 
834 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  37.66 
 
 
844 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  37.89 
 
 
911 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  37.69 
 
 
843 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  36.05 
 
 
831 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  34.95 
 
 
878 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  35.77 
 
 
855 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  35.66 
 
 
887 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  40.13 
 
 
832 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  34.75 
 
 
839 aa  389  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  35.08 
 
 
831 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  36.75 
 
 
833 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  36.05 
 
 
890 aa  379  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  34.17 
 
 
805 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  33.77 
 
 
805 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  32.65 
 
 
802 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  33.98 
 
 
870 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  36.33 
 
 
901 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  34.93 
 
 
868 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  39.17 
 
 
832 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  36.23 
 
 
855 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  36.16 
 
 
833 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  34.81 
 
 
868 aa  364  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  32.33 
 
 
870 aa  364  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  34.69 
 
 
882 aa  365  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  34.78 
 
 
882 aa  363  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  36.33 
 
 
833 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  34.57 
 
 
868 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  34.45 
 
 
868 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  34.45 
 
 
868 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  36.04 
 
 
898 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  36.04 
 
 
898 aa  353  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  36.04 
 
 
898 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  36.04 
 
 
898 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  36.04 
 
 
898 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  36.04 
 
 
898 aa  353  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  36.04 
 
 
898 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  31.71 
 
 
804 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  37.16 
 
 
935 aa  350  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  35.82 
 
 
868 aa  349  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  33.9 
 
 
794 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  34.33 
 
 
842 aa  347  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  36.46 
 
 
868 aa  347  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  33.54 
 
 
794 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  34.34 
 
 
794 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  34.1 
 
 
846 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  35.1 
 
 
867 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  35.1 
 
 
846 aa  334  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  34.8 
 
 
895 aa  331  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  36.34 
 
 
837 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  33.61 
 
 
804 aa  319  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  34.84 
 
 
871 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  32.81 
 
 
845 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  38.31 
 
 
845 aa  294  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  36.87 
 
 
477 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07520  hypothetical protein  32.86 
 
 
737 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  32.15 
 
 
857 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  36.53 
 
 
520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  37.3 
 
 
490 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  34.16 
 
 
488 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  32.96 
 
 
488 aa  242  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  31.12 
 
 
482 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  30.68 
 
 
481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  34.47 
 
 
518 aa  240  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  33.71 
 
 
480 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2636  hypothetical protein  32.44 
 
 
499 aa  239  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  35.66 
 
 
552 aa  239  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  30.55 
 
 
482 aa  238  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  32.67 
 
 
480 aa  237  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  34.67 
 
 
606 aa  236  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  31.63 
 
 
482 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  33.03 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  33.04 
 
 
479 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  33.11 
 
 
477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  30.86 
 
 
469 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  33.05 
 
 
481 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>