More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3098 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  100 
 
 		 853 aa  1752    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  49.28 
 
 		 859 aa  804    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  45.25 
 
 		 851 aa  612  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  35.9 
 
 		 850 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  39.59 
 
 		 828 aa  512  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  37.06 
 
 		 834 aa  507  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  37.86 
 
 		 834 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  36.83 
 
 		 839 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  34.77 
 
 		 907 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  39.13 
 
 		 828 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  38.06 
 
 		 868 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  38.07 
 
 		 831 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  35.73 
 
 		 842 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  37.59 
 
 		 831 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  38.89 
 
 		 832 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  41.38 
 
 		 832 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  37.42 
 
 		 839 aa  482  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  36.72 
 
 		 848 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  34.56 
 
 		 897 aa  481  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  36.39 
 
 		 850 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  36.83 
 
 		 831 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  35.95 
 
 		 877 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  33.91 
 
 		 887 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  37.68 
 
 		 843 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  35.07 
 
 		 871 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  34.65 
 
 		 870 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  34.49 
 
 		 878 aa  452  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  36.51 
 
 		 835 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  36.94 
 
 		 911 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  35.11 
 
 		 877 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  34.38 
 
 		 884 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  34.43 
 
 		 901 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  33.99 
 
 		 885 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  33.99 
 
 		 885 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  33.99 
 
 		 885 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  36 
 
 		 855 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  35.29 
 
 		 844 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  33.96 
 
 		 855 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  33.77 
 
 		 802 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  33.68 
 
 		 804 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  34.4 
 
 		 890 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  35.1 
 
 		 868 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  35.1 
 
 		 898 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  34.98 
 
 		 898 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  34.98 
 
 		 898 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  35.79 
 
 		 833 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  34.12 
 
 		 846 aa  438  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  34.98 
 
 		 898 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  34.98 
 
 		 898 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  34.98 
 
 		 898 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  34.98 
 
 		 898 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  32.93 
 
 		 805 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  34.54 
 
 		 846 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  34.07 
 
 		 870 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  34.62 
 
 		 868 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  35.99 
 
 		 833 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  32.56 
 
 		 882 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  34.49 
 
 		 867 aa  432  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  34.34 
 
 		 882 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  32.84 
 
 		 805 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  35.4 
 
 		 833 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  34.25 
 
 		 868 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  34.25 
 
 		 868 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  34.13 
 
 		 868 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  34.13 
 
 		 868 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  35.78 
 
 		 845 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  33.25 
 
 		 794 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  33.61 
 
 		 868 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  35.32 
 
 		 837 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  33.61 
 
 		 895 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  32.64 
 
 		 794 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  35.43 
 
 		 935 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  32.64 
 
 		 794 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  31.7 
 
 		 804 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  31.57 
 
 		 909 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  35.27 
 
 		 818 aa  382  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  30.58 
 
 		 845 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  33.45 
 
 		 871 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  38.28 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  38.89 
 
 		 480 aa  357  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  38.89 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  37.45 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  38.06 
 
 		 488 aa  342  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  36.85 
 
 		 480 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  36.97 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  36.46 
 
 		 479 aa  333  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  36.53 
 
 		 488 aa  332  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  36.74 
 
 		 497 aa  331  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  34.33 
 
 		 476 aa  330  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  35.28 
 
 		 507 aa  328  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  36.13 
 
 		 489 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  36.11 
 
 		 486 aa  326  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  36.64 
 
 		 476 aa  326  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  36.52 
 
 		 463 aa  326  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  35.7 
 
 		 472 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  35.39 
 
 		 479 aa  326  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  36.52 
 
 		 472 aa  326  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  36.13 
 
 		 472 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  36.85 
 
 		 476 aa  324  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  36.44 
 
 		 507 aa  323  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>