More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1061 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1777    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  47.6 
 
 
870 aa  762    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1777    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  49.88 
 
 
935 aa  725    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  80.18 
 
 
868 aa  1340    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  79.41 
 
 
882 aa  1345    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  99.78 
 
 
898 aa  1770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  53.88 
 
 
911 aa  828    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  96.89 
 
 
868 aa  1642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  80.07 
 
 
868 aa  1335    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1777    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  49.48 
 
 
871 aa  728    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  48.97 
 
 
901 aa  748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1777    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  80.18 
 
 
868 aa  1337    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  45.94 
 
 
890 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1777    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  79.72 
 
 
868 aa  1339    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  80.41 
 
 
868 aa  1324    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  80.18 
 
 
868 aa  1337    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1777    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  42.33 
 
 
887 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  43.02 
 
 
878 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  43.22 
 
 
882 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  44.79 
 
 
895 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  42.34 
 
 
870 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  41.43 
 
 
839 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  41.73 
 
 
828 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  38.58 
 
 
834 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  40.61 
 
 
831 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  40.61 
 
 
831 aa  515  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  41.87 
 
 
828 aa  515  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  41.16 
 
 
832 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  43.26 
 
 
868 aa  505  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  41.72 
 
 
832 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  39.4 
 
 
831 aa  499  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  36.39 
 
 
850 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  38.17 
 
 
907 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  37.63 
 
 
834 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  35.1 
 
 
853 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  36.29 
 
 
844 aa  436  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  36.55 
 
 
833 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  36.59 
 
 
855 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  37.92 
 
 
839 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  35.19 
 
 
833 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  36.51 
 
 
855 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  31.83 
 
 
850 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  36.26 
 
 
867 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  37.15 
 
 
846 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  33.25 
 
 
802 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  36.03 
 
 
833 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  34.83 
 
 
843 aa  409  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  36.66 
 
 
845 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  35.53 
 
 
846 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  33.69 
 
 
859 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  36.93 
 
 
845 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  35.18 
 
 
794 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  34.61 
 
 
897 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  34.37 
 
 
794 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  37.44 
 
 
837 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  31.59 
 
 
805 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  31.71 
 
 
804 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  32.22 
 
 
794 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  31.61 
 
 
805 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  36.41 
 
 
851 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  33.1 
 
 
871 aa  356  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  36.3 
 
 
848 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  31.82 
 
 
804 aa  354  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  35.24 
 
 
835 aa  332  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  33.47 
 
 
842 aa  327  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  33.08 
 
 
884 aa  319  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  31.26 
 
 
877 aa  308  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  31.48 
 
 
885 aa  292  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  31.48 
 
 
885 aa  292  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  31.48 
 
 
885 aa  292  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  31.69 
 
 
877 aa  291  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  36.68 
 
 
553 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  32.26 
 
 
481 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  32.77 
 
 
857 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  35.67 
 
 
567 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  35.67 
 
 
567 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  35.67 
 
 
567 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  35.26 
 
 
544 aa  283  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  33.81 
 
 
470 aa  283  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  33.81 
 
 
476 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  33.91 
 
 
480 aa  281  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  33.69 
 
 
480 aa  280  7e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  34.66 
 
 
488 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  33.54 
 
 
486 aa  280  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  37.64 
 
 
497 aa  279  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  35.51 
 
 
507 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  28.67 
 
 
909 aa  278  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  34.69 
 
 
519 aa  277  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  33.48 
 
 
480 aa  277  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  37.22 
 
 
469 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  35.39 
 
 
606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  36.84 
 
 
526 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  34.35 
 
 
477 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  37.22 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  35.5 
 
 
489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>