More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0656 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  74.01 
 
 		 831 aa  1200    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  73.77 
 
 		 831 aa  1199    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  52.75 
 
 		 839 aa  835    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  72.89 
 
 		 831 aa  1170    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  75.81 
 
 		 828 aa  1223    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  69.9 
 
 		 832 aa  1039    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  46.49 
 
 		 868 aa  659    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  70.86 
 
 		 832 aa  1094    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  48.67 
 
 		 834 aa  729    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  47.35 
 
 		 850 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  43.1 
 
 		 911 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  39.48 
 
 		 870 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  42.75 
 
 		 935 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  40.53 
 
 		 878 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  42.16 
 
 		 907 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  39.24 
 
 		 834 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  39.7 
 
 		 887 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  43.29 
 
 		 890 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  42.21 
 
 		 871 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  42.94 
 
 		 901 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  41.86 
 
 		 882 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  41.86 
 
 		 868 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  41.74 
 
 		 868 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  41.5 
 
 		 868 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  42.24 
 
 		 868 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  41.38 
 
 		 868 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  41.38 
 
 		 868 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  42.29 
 
 		 898 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  40.51 
 
 		 895 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  42.29 
 
 		 898 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  42.29 
 
 		 898 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  42.29 
 
 		 898 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  42.29 
 
 		 898 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  42.29 
 
 		 898 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  44.56 
 
 		 851 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  42.17 
 
 		 898 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  41.86 
 
 		 868 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  40.21 
 
 		 833 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  38.74 
 
 		 859 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  40.5 
 
 		 897 aa  525  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  40.02 
 
 		 882 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  41.74 
 
 		 844 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  39.41 
 
 		 870 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  39.38 
 
 		 855 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  40.45 
 
 		 855 aa  515  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  35.33 
 
 		 850 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  40.86 
 
 		 843 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  39.13 
 
 		 853 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  40.39 
 
 		 839 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  39.69 
 
 		 833 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  41.8 
 
 		 846 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  39.83 
 
 		 846 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  39.83 
 
 		 867 aa  502  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  38.36 
 
 		 833 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  37.6 
 
 		 805 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  37.42 
 
 		 804 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  37.37 
 
 		 805 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  41.24 
 
 		 837 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  36.76 
 
 		 802 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  39.71 
 
 		 845 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  37.32 
 
 		 804 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  37.75 
 
 		 845 aa  439  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  36.9 
 
 		 794 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  37.24 
 
 		 794 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  37.24 
 
 		 794 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  35.35 
 
 		 884 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  38.93 
 
 		 848 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  36.66 
 
 		 885 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  36.66 
 
 		 885 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  36.66 
 
 		 885 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  40.37 
 
 		 835 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  38.32 
 
 		 871 aa  416  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  37.58 
 
 		 877 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  37.12 
 
 		 877 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  34.45 
 
 		 909 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  35.48 
 
 		 842 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  36.07 
 
 		 818 aa  365  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  37.21 
 
 		 857 aa  363  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  40 
 
 		 489 aa  357  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  38.59 
 
 		 480 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  41.08 
 
 		 470 aa  350  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  39.74 
 
 		 488 aa  349  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  40.93 
 
 		 488 aa  348  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  40.65 
 
 		 470 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  37.95 
 
 		 477 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  39.46 
 
 		 497 aa  344  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  38.21 
 
 		 567 aa  343  7e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  38.21 
 
 		 567 aa  343  7e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  38.21 
 
 		 567 aa  343  7e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  37.6 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  37.1 
 
 		 544 aa  343  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  37.76 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  40.87 
 
 		 526 aa  340  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  37.66 
 
 		 480 aa  340  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  38.71 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  37.69 
 
 		 481 aa  338  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  38.95 
 
 		 553 aa  337  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  39.57 
 
 		 469 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  38.92 
 
 		 494 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>