More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4006 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  79.41 
 
 		 898 aa  1340    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  79.41 
 
 		 898 aa  1340    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  79.41 
 
 		 898 aa  1340    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  46.19 
 
 		 890 aa  678    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  95.74 
 
 		 868 aa  1602    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  49.12 
 
 		 935 aa  730    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  42.98 
 
 		 878 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  94.59 
 
 		 868 aa  1584    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  80.3 
 
 		 868 aa  1355    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  100 
 
 		 882 aa  1748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  79.41 
 
 		 898 aa  1340    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  48.15 
 
 		 871 aa  730    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  47.67 
 
 		 901 aa  734    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  93.2 
 
 		 868 aa  1541    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  44.68 
 
 		 882 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  79.41 
 
 		 898 aa  1340    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  94.47 
 
 		 868 aa  1581    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  79.41 
 
 		 898 aa  1339    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  79.41 
 
 		 898 aa  1340    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  98.96 
 
 		 868 aa  1706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  53.02 
 
 		 911 aa  826    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  94.47 
 
 		 868 aa  1581    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  45.24 
 
 		 870 aa  756    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  41.93 
 
 		 887 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  44.28 
 
 		 895 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  40.71 
 
 		 870 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  40.21 
 
 		 839 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  41.31 
 
 		 828 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  39.79 
 
 		 828 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  39.39 
 
 		 831 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  36.89 
 
 		 834 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  39.39 
 
 		 831 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  42.4 
 
 		 868 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  40.27 
 
 		 832 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  39.3 
 
 		 831 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  40.51 
 
 		 832 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  36.04 
 
 		 850 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  37.38 
 
 		 834 aa  456  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  37.5 
 
 		 907 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  34.58 
 
 		 853 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  36.41 
 
 		 855 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  32.47 
 
 		 850 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  36.54 
 
 		 844 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  37.4 
 
 		 839 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  35.43 
 
 		 833 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  35.48 
 
 		 843 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  35.1 
 
 		 833 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  35.37 
 
 		 855 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  34.42 
 
 		 859 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  35.12 
 
 		 833 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  35.21 
 
 		 846 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  36.87 
 
 		 846 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  36.73 
 
 		 867 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  32.47 
 
 		 802 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  33.65 
 
 		 845 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  35.48 
 
 		 845 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  33.02 
 
 		 897 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  33.01 
 
 		 794 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  32.69 
 
 		 805 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  32.63 
 
 		 805 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  33.09 
 
 		 794 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  36.13 
 
 		 837 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  35.56 
 
 		 851 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  32.85 
 
 		 794 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  31.65 
 
 		 804 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  31.57 
 
 		 804 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  34.57 
 
 		 848 aa  364  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  33.29 
 
 		 871 aa  360  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  32.03 
 
 		 877 aa  344  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  34.78 
 
 		 835 aa  336  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  32.49 
 
 		 884 aa  332  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  33.07 
 
 		 842 aa  331  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  31.68 
 
 		 885 aa  325  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  31.57 
 
 		 885 aa  324  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  31.57 
 
 		 885 aa  324  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  31.38 
 
 		 877 aa  319  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  32.86 
 
 		 857 aa  295  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  36.53 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  34.15 
 
 		 470 aa  288  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  36.86 
 
 		 539 aa  287  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  36.92 
 
 		 469 aa  286  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  37.61 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  33.97 
 
 		 481 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  37.61 
 
 		 469 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  35.25 
 
 		 488 aa  284  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  32.74 
 
 		 486 aa  284  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  34.25 
 
 		 606 aa  283  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  38.05 
 
 		 526 aa  282  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  34.34 
 
 		 481 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  36.87 
 
 		 492 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  35.64 
 
 		 469 aa  281  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  37.83 
 
 		 470 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  37.47 
 
 		 469 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  36.95 
 
 		 469 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  36.34 
 
 		 494 aa  280  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  37.44 
 
 		 480 aa  279  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  35.64 
 
 		 469 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  35.91 
 
 		 518 aa  279  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  33.88 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  33.88 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>