More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2497 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  49.19 
 
 		 898 aa  727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  49.19 
 
 		 898 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  44.85 
 
 		 890 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  48.2 
 
 		 868 aa  729    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  53.26 
 
 		 870 aa  874    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  49.19 
 
 		 898 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  63.59 
 
 		 911 aa  1026    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  50.64 
 
 		 868 aa  755    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  49.19 
 
 		 898 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  100 
 
 		 871 aa  1756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  45.75 
 
 		 935 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  55.67 
 
 		 901 aa  882    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  48.03 
 
 		 868 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  48.26 
 
 		 868 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  49.19 
 
 		 898 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  49.19 
 
 		 898 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  48.25 
 
 		 868 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  48.37 
 
 		 882 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  48.26 
 
 		 868 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  48.14 
 
 		 868 aa  732    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  49.19 
 
 		 898 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  41.32 
 
 		 870 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  40.95 
 
 		 882 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  39.82 
 
 		 887 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  40.67 
 
 		 878 aa  588  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  41.87 
 
 		 895 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  39.43 
 
 		 839 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  40.83 
 
 		 828 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  42.45 
 
 		 828 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  39.26 
 
 		 831 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  41.21 
 
 		 831 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  41.71 
 
 		 831 aa  495  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  40.31 
 
 		 832 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  41.51 
 
 		 868 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  39.6 
 
 		 832 aa  476  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  37.8 
 
 		 850 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  35.53 
 
 		 834 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  36.91 
 
 		 833 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  35.96 
 
 		 834 aa  445  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  38.11 
 
 		 844 aa  442  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  37.38 
 
 		 833 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  35.66 
 
 		 855 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  36.27 
 
 		 855 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  36.81 
 
 		 833 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  37.37 
 
 		 867 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  37.48 
 
 		 846 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  37.04 
 
 		 846 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  37.09 
 
 		 839 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  37.23 
 
 		 843 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  34.75 
 
 		 805 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  34.75 
 
 		 805 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  34.97 
 
 		 802 aa  399  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  34.31 
 
 		 907 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  33.97 
 
 		 804 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  35.05 
 
 		 794 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  35.1 
 
 		 794 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  33.45 
 
 		 853 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  32.45 
 
 		 859 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  30.66 
 
 		 850 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  35.1 
 
 		 794 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  34.26 
 
 		 845 aa  376  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  35.65 
 
 		 837 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  34.16 
 
 		 845 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  36.1 
 
 		 851 aa  359  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  33.38 
 
 		 897 aa  353  7e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  32.86 
 
 		 804 aa  352  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  35.1 
 
 		 848 aa  332  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  32.52 
 
 		 871 aa  317  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  31.15 
 
 		 884 aa  308  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  31.58 
 
 		 885 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  32.36 
 
 		 842 aa  303  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  31.58 
 
 		 885 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  31.58 
 
 		 885 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  33.56 
 
 		 835 aa  301  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  31.25 
 
 		 877 aa  288  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  31.02 
 
 		 877 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  37.64 
 
 		 497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  34.65 
 
 		 520 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  33.33 
 
 		 518 aa  258  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  35.33 
 
 		 552 aa  257  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  32.29 
 
 		 471 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  29.96 
 
 		 857 aa  254  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  31.54 
 
 		 482 aa  254  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  33.69 
 
 		 477 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  30.02 
 
 		 909 aa  254  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  32.9 
 
 		 480 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  32.59 
 
 		 606 aa  253  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  34.53 
 
 		 567 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  34.53 
 
 		 567 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  33.33 
 
 		 477 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  34.53 
 
 		 567 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  31.07 
 
 		 464 aa  251  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  31.97 
 
 		 491 aa  252  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  33.54 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  34.66 
 
 		 470 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  31.66 
 
 		 476 aa  251  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  31.42 
 
 		 479 aa  251  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  32.74 
 
 		 519 aa  251  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  33.4 
 
 		 469 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>