More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3770 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  73.69 
 
 
885 aa  1275    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  100 
 
 
877 aa  1734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  73.8 
 
 
885 aa  1276    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  45.58 
 
 
909 aa  666    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  67.43 
 
 
884 aa  1146    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  73.8 
 
 
885 aa  1276    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  48.86 
 
 
871 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  84.05 
 
 
877 aa  1428    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  45.2 
 
 
818 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  41.72 
 
 
848 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  40.23 
 
 
835 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  35.95 
 
 
853 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  34.78 
 
 
859 aa  452  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  38.81 
 
 
851 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  35.92 
 
 
828 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  37.62 
 
 
832 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  35.25 
 
 
831 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  35.42 
 
 
831 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  37.14 
 
 
832 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  35.61 
 
 
868 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  36.2 
 
 
831 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  33.37 
 
 
839 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  30.15 
 
 
850 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  37.58 
 
 
828 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  32.77 
 
 
907 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  33.01 
 
 
897 aa  373  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  32.44 
 
 
834 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  32.24 
 
 
802 aa  361  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  33.25 
 
 
834 aa  359  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  31.41 
 
 
850 aa  357  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  33.87 
 
 
844 aa  356  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  33.94 
 
 
846 aa  349  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  33 
 
 
843 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  33.61 
 
 
855 aa  346  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  33.49 
 
 
842 aa  345  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  34.7 
 
 
867 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  34.62 
 
 
846 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  32.84 
 
 
890 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  32.12 
 
 
839 aa  340  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  30.94 
 
 
804 aa  338  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  32.04 
 
 
868 aa  337  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  33.89 
 
 
855 aa  336  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  32.04 
 
 
882 aa  336  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  32.61 
 
 
833 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  29.24 
 
 
870 aa  331  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  32.94 
 
 
845 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  32.28 
 
 
805 aa  330  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  32.16 
 
 
868 aa  327  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  31.76 
 
 
805 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  31.74 
 
 
868 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  31.1 
 
 
868 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  31.7 
 
 
878 aa  321  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  30.99 
 
 
868 aa  320  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  30.99 
 
 
868 aa  320  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  32.83 
 
 
833 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  34.28 
 
 
837 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  31.94 
 
 
794 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  31.94 
 
 
794 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  32.11 
 
 
911 aa  316  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  32.71 
 
 
833 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  30.35 
 
 
887 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  32.29 
 
 
794 aa  313  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  30.33 
 
 
870 aa  310  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  31.8 
 
 
868 aa  308  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  30.9 
 
 
901 aa  301  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  30.95 
 
 
898 aa  301  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  30.95 
 
 
898 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  30.95 
 
 
898 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  30.95 
 
 
898 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  30.95 
 
 
898 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  30.95 
 
 
898 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  30.95 
 
 
898 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  31.97 
 
 
895 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  30.91 
 
 
882 aa  287  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  30.61 
 
 
845 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  31.85 
 
 
935 aa  284  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  29.83 
 
 
804 aa  280  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  30.8 
 
 
871 aa  272  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07520  hypothetical protein  33.52 
 
 
737 aa  265  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  31.87 
 
 
857 aa  253  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  35.64 
 
 
553 aa  250  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  34.27 
 
 
480 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  34.45 
 
 
507 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  33.26 
 
 
606 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  33.94 
 
 
477 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  33.94 
 
 
488 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  31.81 
 
 
518 aa  239  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  33.74 
 
 
567 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  33.74 
 
 
567 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  33.74 
 
 
567 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  33.26 
 
 
476 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  32.18 
 
 
470 aa  238  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  33.18 
 
 
488 aa  235  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  33.68 
 
 
526 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  34.64 
 
 
552 aa  234  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  31.81 
 
 
520 aa  233  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  33.26 
 
 
519 aa  233  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  30.56 
 
 
482 aa  232  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  32.43 
 
 
480 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  34 
 
 
490 aa  231  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>