278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0856 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  52.39 
 
 		 794 aa  779    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  51.39 
 
 		 802 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  52.59 
 
 		 794 aa  784    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  52.59 
 
 		 794 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  51.27 
 
 		 805 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  50.32 
 
 		 804 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 804 aa  1613    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  51.85 
 
 		 805 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  43.16 
 
 		 855 aa  618  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  41.29 
 
 		 834 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  40.37 
 
 		 839 aa  596  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  42.09 
 
 		 855 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  43.09 
 
 		 833 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  42.8 
 
 		 833 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  40.9 
 
 		 844 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  40.07 
 
 		 843 aa  558  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  41.74 
 
 		 833 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  40.62 
 
 		 846 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  40.25 
 
 		 867 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  42.27 
 
 		 846 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  39.53 
 
 		 837 aa  482  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  37.25 
 
 		 845 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  37.89 
 
 		 907 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  35.55 
 
 		 834 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  35.39 
 
 		 839 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  37.87 
 
 		 828 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  36.33 
 
 		 845 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  36.99 
 
 		 868 aa  438  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  36.41 
 
 		 831 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  37.32 
 
 		 828 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  37.95 
 
 		 831 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  35.87 
 
 		 831 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  37 
 
 		 832 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  36.34 
 
 		 851 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  34.4 
 
 		 850 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  37.38 
 
 		 832 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  31.69 
 
 		 897 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  32.03 
 
 		 853 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  35.48 
 
 		 911 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  34.09 
 
 		 878 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  33.25 
 
 		 887 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  29.74 
 
 		 850 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  34.35 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  34.2 
 
 		 901 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  33.21 
 
 		 870 aa  382  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  32.52 
 
 		 859 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  34.75 
 
 		 935 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  34.3 
 
 		 890 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  31.69 
 
 		 882 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  32.01 
 
 		 868 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  31.57 
 
 		 868 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  32.62 
 
 		 868 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  31.64 
 
 		 868 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  31.64 
 
 		 868 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  31.64 
 
 		 868 aa  364  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  31.86 
 
 		 868 aa  360  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  34.15 
 
 		 882 aa  354  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  33.54 
 
 		 895 aa  353  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  32.02 
 
 		 898 aa  352  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  32.02 
 
 		 898 aa  352  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  32.02 
 
 		 898 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  32.02 
 
 		 898 aa  352  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  32.02 
 
 		 898 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  32.02 
 
 		 898 aa  352  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  32.02 
 
 		 898 aa  350  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  32.01 
 
 		 842 aa  348  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  32.99 
 
 		 871 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  34.16 
 
 		 848 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  31.94 
 
 		 871 aa  312  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  34.16 
 
 		 835 aa  305  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  29.48 
 
 		 884 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  29.83 
 
 		 877 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  29.87 
 
 		 885 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  29.87 
 
 		 885 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  29.87 
 
 		 885 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  31.24 
 
 		 486 aa  275  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  29.62 
 
 		 877 aa  275  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  31.46 
 
 		 857 aa  272  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  33.06 
 
 		 488 aa  269  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  34.55 
 
 		 507 aa  267  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  32.42 
 
 		 470 aa  266  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  31.45 
 
 		 470 aa  266  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  31.78 
 
 		 479 aa  263  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  27.91 
 
 		 909 aa  263  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  31.24 
 
 		 477 aa  262  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  32.14 
 
 		 471 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  32.14 
 
 		 471 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  31.5 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  31.71 
 
 		 471 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  32.14 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  30.51 
 
 		 464 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  32.14 
 
 		 477 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  32.14 
 
 		 477 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  32.27 
 
 		 477 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  31.71 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  31.5 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  31.71 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  32.14 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  32.14 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  33.19 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>