More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2321 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  48.21 
 
 		 871 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  73.8 
 
 		 877 aa  1276    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  99.89 
 
 		 885 aa  1738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  46.2 
 
 		 909 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  100 
 
 		 885 aa  1739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  69.66 
 
 		 884 aa  1209    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  100 
 
 		 885 aa  1739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  75.63 
 
 		 877 aa  1292    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  45.78 
 
 		 818 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  41.71 
 
 		 848 aa  509  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  40.37 
 
 		 835 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  33.99 
 
 		 853 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  37.66 
 
 		 851 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  33.79 
 
 		 859 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  37.06 
 
 		 828 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  35.47 
 
 		 831 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  35.23 
 
 		 831 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  36.63 
 
 		 831 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  37.14 
 
 		 832 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  36.63 
 
 		 832 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  35.33 
 
 		 868 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  36.66 
 
 		 828 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  30.13 
 
 		 850 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  32.4 
 
 		 834 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  33.18 
 
 		 839 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  33.98 
 
 		 834 aa  366  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  33.5 
 
 		 907 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  31.01 
 
 		 897 aa  352  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  33.53 
 
 		 843 aa  351  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  31.34 
 
 		 878 aa  350  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  32.95 
 
 		 839 aa  347  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  34.78 
 
 		 846 aa  347  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  30.93 
 
 		 887 aa  347  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  32.73 
 
 		 844 aa  346  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  34.46 
 
 		 867 aa  346  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  34.06 
 
 		 842 aa  346  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  31.65 
 
 		 850 aa  345  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  34.06 
 
 		 846 aa  344  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  30.8 
 
 		 870 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  32.82 
 
 		 855 aa  337  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  29.52 
 
 		 870 aa  336  9e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  31.66 
 
 		 911 aa  330  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  30.8 
 
 		 890 aa  328  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  33.29 
 
 		 855 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  32.91 
 
 		 794 aa  327  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  33.29 
 
 		 833 aa  326  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  33 
 
 		 794 aa  326  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  31.06 
 
 		 802 aa  326  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  31.68 
 
 		 868 aa  324  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  31.68 
 
 		 882 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  32.38 
 
 		 868 aa  320  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  31.68 
 
 		 868 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  31.89 
 
 		 901 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  31.68 
 
 		 868 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  31.68 
 
 		 868 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  29.12 
 
 		 804 aa  312  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  31.02 
 
 		 805 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  30.64 
 
 		 805 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  31.79 
 
 		 833 aa  311  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  31.74 
 
 		 794 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  31.49 
 
 		 868 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  32.04 
 
 		 833 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  32.37 
 
 		 837 aa  301  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  31.49 
 
 		 845 aa  299  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  31.85 
 
 		 868 aa  296  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  32.52 
 
 		 895 aa  296  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  31.55 
 
 		 935 aa  292  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  30.2 
 
 		 882 aa  290  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  31.09 
 
 		 871 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  31.55 
 
 		 898 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  31.55 
 
 		 898 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  31.55 
 
 		 898 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  31.55 
 
 		 898 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  31.55 
 
 		 898 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  31.55 
 
 		 898 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  31.42 
 
 		 898 aa  280  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  29.49 
 
 		 804 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  31.13 
 
 		 857 aa  262  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  30.31 
 
 		 845 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07520  hypothetical protein  33.29 
 
 		 737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  33.85 
 
 		 553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  33.04 
 
 		 488 aa  245  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  33.61 
 
 		 567 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  33.61 
 
 		 567 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  33.61 
 
 		 567 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  31.12 
 
 		 482 aa  240  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  33.12 
 
 		 520 aa  240  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  33.12 
 
 		 518 aa  239  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  32.27 
 
 		 480 aa  236  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  32.27 
 
 		 480 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  30.91 
 
 		 489 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  31.9 
 
 		 480 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  32.43 
 
 		 606 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  31.59 
 
 		 477 aa  234  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  33.56 
 
 		 471 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  31.59 
 
 		 480 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  32.72 
 
 		 526 aa  233  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  33.61 
 
 		 488 aa  233  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  32.69 
 
 		 476 aa  233  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  33.25 
 
 		 507 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>