More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3511 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  100 
 
 		 850 aa  1762    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  38.11 
 
 		 851 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  35.9 
 
 		 853 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  36.33 
 
 		 859 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  36.49 
 
 		 828 aa  505  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  38.55 
 
 		 831 aa  492  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  39.36 
 
 		 831 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  35.33 
 
 		 828 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  36.41 
 
 		 868 aa  489  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  33.25 
 
 		 839 aa  482  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  33.88 
 
 		 834 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  35.12 
 
 		 832 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  33.41 
 
 		 907 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  32.4 
 
 		 897 aa  462  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  33.88 
 
 		 834 aa  458  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 850 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  33.9 
 
 		 855 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  33.49 
 
 		 901 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  33.21 
 
 		 831 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  33.25 
 
 		 843 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  34.95 
 
 		 832 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  32.85 
 
 		 911 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  32.82 
 
 		 870 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  33.56 
 
 		 848 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  31.24 
 
 		 878 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  30.46 
 
 		 887 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  33.76 
 
 		 839 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  31.27 
 
 		 842 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  33.17 
 
 		 855 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  32.59 
 
 		 868 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  32.61 
 
 		 844 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  32.59 
 
 		 882 aa  426  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  32.13 
 
 		 868 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  32.32 
 
 		 833 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  32 
 
 		 868 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  32.12 
 
 		 833 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  31.03 
 
 		 870 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  32.35 
 
 		 868 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  32.35 
 
 		 868 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  32.35 
 
 		 868 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  31.72 
 
 		 802 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  30.96 
 
 		 804 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  32.97 
 
 		 868 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  31.7 
 
 		 833 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  31.96 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  31.96 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  31.96 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  32.32 
 
 		 890 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  31.96 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  31.96 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  31.96 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  31.96 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  30.73 
 
 		 805 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  30.37 
 
 		 805 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  32.56 
 
 		 846 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  30.68 
 
 		 794 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  30.37 
 
 		 884 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  31.17 
 
 		 835 aa  389  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  30.17 
 
 		 837 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  31.75 
 
 		 846 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  30.13 
 
 		 885 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  30.98 
 
 		 871 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  30.13 
 
 		 885 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  31.62 
 
 		 867 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  30.13 
 
 		 885 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  29.74 
 
 		 804 aa  386  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  30.8 
 
 		 935 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  30.15 
 
 		 877 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  30.22 
 
 		 794 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  29.56 
 
 		 877 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  30.1 
 
 		 794 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  31.29 
 
 		 845 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  30.78 
 
 		 882 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  31.49 
 
 		 895 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  32.21 
 
 		 871 aa  361  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  30.7 
 
 		 845 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  37.79 
 
 		 489 aa  351  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  28.69 
 
 		 909 aa  351  4e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  36.27 
 
 		 480 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  36.4 
 
 		 480 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  36.05 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  37.08 
 
 		 488 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  37.71 
 
 		 488 aa  336  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  34.93 
 
 		 488 aa  334  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  36.38 
 
 		 486 aa  333  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  35.74 
 
 		 482 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  34.69 
 
 		 471 aa  330  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  34.03 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  35.88 
 
 		 482 aa  328  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  35.26 
 
 		 476 aa  326  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  35.16 
 
 		 480 aa  325  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  34.69 
 
 		 477 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  35.18 
 
 		 482 aa  323  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  34.89 
 
 		 507 aa  323  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  35.39 
 
 		 476 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  35.34 
 
 		 487 aa  320  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  35.34 
 
 		 487 aa  320  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  33.62 
 
 		 476 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  34.17 
 
 		 481 aa  320  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  34.3 
 
 		 488 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>