More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3009 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  51.67 
 
 		 831 aa  808    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  52.03 
 
 		 831 aa  810    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  100 
 
 		 839 aa  1706    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  52.81 
 
 		 828 aa  842    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  47.6 
 
 		 868 aa  714    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  52.75 
 
 		 828 aa  807    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  52.88 
 
 		 832 aa  785    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  53.64 
 
 		 832 aa  823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  51.67 
 
 		 831 aa  793    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  49.33 
 
 		 834 aa  784    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  48.66 
 
 		 850 aa  774    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  42.11 
 
 		 907 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  41.83 
 
 		 911 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  39.38 
 
 		 897 aa  572  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  41.91 
 
 		 868 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  39.2 
 
 		 870 aa  572  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  41.96 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  41.96 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  41.96 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  41.96 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  41.96 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  41.96 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  41.19 
 
 		 834 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  40.31 
 
 		 901 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  41.84 
 
 		 898 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  39.55 
 
 		 887 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  40.4 
 
 		 882 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  40.11 
 
 		 878 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  39.86 
 
 		 868 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  40.16 
 
 		 868 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  38.68 
 
 		 859 aa  552  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  40.12 
 
 		 935 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  43.11 
 
 		 890 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  39.84 
 
 		 868 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  39.84 
 
 		 868 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  39.84 
 
 		 868 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  39.93 
 
 		 868 aa  545  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  40.83 
 
 		 844 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  41.54 
 
 		 839 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  40.71 
 
 		 855 aa  532  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  38.27 
 
 		 882 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  39.01 
 
 		 870 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  39.31 
 
 		 871 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  40.7 
 
 		 833 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  39.67 
 
 		 833 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  40.42 
 
 		 843 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  38.36 
 
 		 805 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  38.49 
 
 		 805 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  39.93 
 
 		 833 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  41.36 
 
 		 851 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  36.83 
 
 		 853 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  38.38 
 
 		 855 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  38.95 
 
 		 802 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  36.71 
 
 		 804 aa  502  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  37.98 
 
 		 895 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  39.39 
 
 		 794 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  39.92 
 
 		 794 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  39.92 
 
 		 794 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  33.25 
 
 		 850 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  38.22 
 
 		 846 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  38.79 
 
 		 867 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  37.64 
 
 		 846 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  36.96 
 
 		 845 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  40 
 
 		 837 aa  446  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  35.56 
 
 		 804 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  36.83 
 
 		 848 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  36.07 
 
 		 845 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  35.38 
 
 		 842 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  37.3 
 
 		 835 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  33.37 
 
 		 877 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  33.57 
 
 		 884 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  33.21 
 
 		 877 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  33.57 
 
 		 871 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  33.06 
 
 		 885 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  33.18 
 
 		 885 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  33.18 
 
 		 885 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  38.22 
 
 		 480 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  38.51 
 
 		 477 aa  349  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  33.38 
 
 		 909 aa  344  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  39.96 
 
 		 489 aa  341  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  38.94 
 
 		 488 aa  340  5e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  34.06 
 
 		 857 aa  339  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  37.34 
 
 		 486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  36.46 
 
 		 482 aa  333  7.000000000000001e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  37.53 
 
 		 477 aa  332  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  36.94 
 
 		 480 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  36.36 
 
 		 482 aa  331  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  36.73 
 
 		 480 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  38.85 
 
 		 488 aa  330  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  36.08 
 
 		 482 aa  328  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  35.82 
 
 		 482 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  38.64 
 
 		 476 aa  327  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  36.46 
 
 		 501 aa  326  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  36.21 
 
 		 481 aa  326  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  38.08 
 
 		 488 aa  325  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  37.95 
 
 		 480 aa  324  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  38.17 
 
 		 488 aa  323  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  34.6 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  36.38 
 
 		 486 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  35.97 
 
 		 481 aa  320  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>