More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0987 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  100 
 
 
859 aa  1760    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  48.86 
 
 
853 aa  822    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  41.23 
 
 
851 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  38.68 
 
 
839 aa  561  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  36.33 
 
 
850 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  37.5 
 
 
834 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  38.91 
 
 
832 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  37.96 
 
 
828 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  38.34 
 
 
832 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  36.32 
 
 
897 aa  508  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  38.74 
 
 
828 aa  505  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  38.59 
 
 
831 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  38.74 
 
 
831 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  36.31 
 
 
850 aa  499  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  36.78 
 
 
831 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  35.95 
 
 
907 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  35.38 
 
 
834 aa  485  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  35.02 
 
 
871 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  35.02 
 
 
848 aa  466  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  34.78 
 
 
877 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  37.97 
 
 
868 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  35.72 
 
 
839 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  34.49 
 
 
884 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  33.79 
 
 
885 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  33.79 
 
 
885 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  33.79 
 
 
885 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  33.99 
 
 
887 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  33.57 
 
 
867 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  33.49 
 
 
846 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  34.18 
 
 
901 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  34.33 
 
 
833 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  34.38 
 
 
911 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  35.34 
 
 
870 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  33.33 
 
 
846 aa  439  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  35.02 
 
 
870 aa  438  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  34.71 
 
 
842 aa  439  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  34 
 
 
878 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  35.43 
 
 
833 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  33.76 
 
 
877 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  36.48 
 
 
835 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  34.91 
 
 
833 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  35.11 
 
 
844 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  32.52 
 
 
882 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  34.73 
 
 
855 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  32.7 
 
 
845 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  32.97 
 
 
855 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  32.84 
 
 
802 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  34.1 
 
 
868 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  34.06 
 
 
882 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  32.59 
 
 
843 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  34.18 
 
 
868 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  34.06 
 
 
868 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  34.06 
 
 
868 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  33.94 
 
 
868 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  33.94 
 
 
868 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  33.57 
 
 
898 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  33.49 
 
 
895 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  33.57 
 
 
898 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  33.59 
 
 
890 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  33.45 
 
 
868 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  33.57 
 
 
898 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  33.57 
 
 
898 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  33.57 
 
 
898 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  33.57 
 
 
898 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  33.45 
 
 
898 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  31.53 
 
 
794 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  33.7 
 
 
837 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  30.79 
 
 
805 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  32.03 
 
 
794 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  31.23 
 
 
804 aa  399  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  31.56 
 
 
794 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  30.99 
 
 
805 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  34.13 
 
 
935 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  32.17 
 
 
909 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  32.71 
 
 
818 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  32.13 
 
 
804 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  30.86 
 
 
845 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  32.45 
 
 
871 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  35.29 
 
 
507 aa  318  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  34.51 
 
 
481 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  36.83 
 
 
488 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  35.77 
 
 
488 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  34.89 
 
 
477 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  35.94 
 
 
480 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  35.76 
 
 
480 aa  303  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  36.88 
 
 
497 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  34.11 
 
 
501 aa  301  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  35.83 
 
 
482 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  36.5 
 
 
489 aa  298  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  32.92 
 
 
482 aa  294  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  35.08 
 
 
476 aa  294  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  34.9 
 
 
476 aa  291  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  33.55 
 
 
469 aa  290  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  34.66 
 
 
486 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  33.12 
 
 
469 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  32.98 
 
 
476 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  34.53 
 
 
480 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  29.97 
 
 
857 aa  286  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  33.55 
 
 
482 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  34.62 
 
 
464 aa  286  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>