More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3281 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  45.32 
 
 		 805 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  49.58 
 
 		 845 aa  752    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  53.01 
 
 		 855 aa  808    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  69.18 
 
 		 839 aa  1161    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  50.73 
 
 		 846 aa  798    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  56.44 
 
 		 833 aa  910    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  55.88 
 
 		 833 aa  906    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  57.28 
 
 		 855 aa  927    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  45.21 
 
 		 802 aa  696    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  47.72 
 
 		 845 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  44.82 
 
 		 805 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  56.53 
 
 		 833 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  43.46 
 
 		 804 aa  675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  51.5 
 
 		 837 aa  767    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  56.28 
 
 		 843 aa  921    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  100 
 
 		 834 aa  1694    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  50.85 
 
 		 867 aa  799    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  50.61 
 
 		 846 aa  805    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  58.27 
 
 		 844 aa  941    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  42.48 
 
 		 794 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  42.48 
 
 		 794 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  41.29 
 
 		 804 aa  610  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  41.47 
 
 		 794 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  41.19 
 
 		 839 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  40.46 
 
 		 907 aa  551  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  41.81 
 
 		 868 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  41.78 
 
 		 828 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  39.24 
 
 		 828 aa  528  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  37.57 
 
 		 850 aa  519  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  41.79 
 
 		 832 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  41.04 
 
 		 831 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  37.06 
 
 		 853 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  39.74 
 
 		 831 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  39.34 
 
 		 831 aa  502  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  42.21 
 
 		 832 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  37.73 
 
 		 834 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  36.01 
 
 		 897 aa  497  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  38.04 
 
 		 911 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  38.33 
 
 		 851 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  35.38 
 
 		 859 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  37.8 
 
 		 878 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  36.59 
 
 		 868 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  36.63 
 
 		 901 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  37.47 
 
 		 868 aa  459  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  36.5 
 
 		 887 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  37.47 
 
 		 868 aa  459  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  37.47 
 
 		 868 aa  459  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  33.88 
 
 		 850 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  37.5 
 
 		 868 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  37.91 
 
 		 935 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  36.14 
 
 		 882 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  38.85 
 
 		 890 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  36.74 
 
 		 868 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  36.99 
 
 		 868 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  37.47 
 
 		 898 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  37.47 
 
 		 898 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  37.47 
 
 		 898 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  37.47 
 
 		 898 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  37.47 
 
 		 898 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  37.47 
 
 		 898 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  37.47 
 
 		 898 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 870 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  36.61 
 
 		 870 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  35.84 
 
 		 871 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  36.94 
 
 		 895 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  36.95 
 
 		 882 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  34.37 
 
 		 848 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  33.46 
 
 		 842 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  33.98 
 
 		 885 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  33.98 
 
 		 885 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  33.98 
 
 		 885 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  33.25 
 
 		 877 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  32.39 
 
 		 884 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  32.17 
 
 		 877 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  34.39 
 
 		 835 aa  353  8e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  31.84 
 
 		 871 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  31.83 
 
 		 857 aa  331  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  34.58 
 
 		 818 aa  315  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  30.6 
 
 		 909 aa  310  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  36.51 
 
 		 489 aa  305  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  34.58 
 
 		 482 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  35.5 
 
 		 476 aa  297  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  33.68 
 
 		 480 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  34.33 
 
 		 470 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  35.71 
 
 		 476 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  34.12 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  33.68 
 
 		 480 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  33.06 
 
 		 480 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  32.2 
 
 		 469 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  34.62 
 
 		 497 aa  293  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  32.2 
 
 		 469 aa  291  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  32.92 
 
 		 477 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  33.76 
 
 		 470 aa  290  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  34.97 
 
 		 494 aa  290  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  32.34 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  33.9 
 
 		 469 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  35.05 
 
 		 480 aa  288  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5372  protein of unknown function DUF403  48.09 
 
 		 360 aa  287  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  33.96 
 
 		 507 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  32.42 
 
 		 469 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>