200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5372 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5372  protein of unknown function DUF403  100 
 
 		 360 aa  699    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  82.78 
 
 		 837 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  50.68 
 
 		 867 aa  305  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  50.68 
 
 		 846 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  50.82 
 
 		 846 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  50.14 
 
 		 833 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  48.09 
 
 		 834 aa  295  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  49.45 
 
 		 844 aa  291  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  48.76 
 
 		 833 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  47.11 
 
 		 855 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  51.52 
 
 		 843 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  49.04 
 
 		 839 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  50.82 
 
 		 845 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  48.91 
 
 		 833 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  44.73 
 
 		 855 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  41.33 
 
 		 845 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  31.61 
 
 		 897 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  30.28 
 
 		 804 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  29.92 
 
 		 805 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  29.94 
 
 		 805 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  31.4 
 
 		 907 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  28.94 
 
 		 802 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  35.45 
 
 		 868 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  30.64 
 
 		 804 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  28.27 
 
 		 870 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  30.65 
 
 		 853 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  35.64 
 
 		 857 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 842 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  34.97 
 
 		 851 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  30.24 
 
 		 794 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  30.24 
 
 		 794 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  32 
 
 		 828 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  30.86 
 
 		 834 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  30.21 
 
 		 794 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  34.77 
 
 		 882 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  30.48 
 
 		 839 aa  97.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  31.23 
 
 		 898 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  31.23 
 
 		 898 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  31.23 
 
 		 898 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  31.23 
 
 		 898 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  31.23 
 
 		 898 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  31.23 
 
 		 898 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  31.23 
 
 		 898 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  33.44 
 
 		 828 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  34.38 
 
 		 868 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  33.56 
 
 		 835 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  32.81 
 
 		 868 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  30.56 
 
 		 868 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  31.2 
 
 		 877 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  28.33 
 
 		 859 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  33.98 
 
 		 868 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  32.55 
 
 		 868 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  32.55 
 
 		 868 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  32.55 
 
 		 868 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  30.2 
 
 		 871 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  30.26 
 
 		 911 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  32.93 
 
 		 832 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  32.21 
 
 		 831 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  32.23 
 
 		 882 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  29.14 
 
 		 885 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  33 
 
 		 831 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  29.14 
 
 		 885 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  30 
 
 		 885 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  30.7 
 
 		 935 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  34.46 
 
 		 832 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  29.9 
 
 		 884 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  32.4 
 
 		 848 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  29.38 
 
 		 901 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  24.69 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3910  hypothetical protein  28.48 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  33.21 
 
 		 850 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  22.7 
 
 		 850 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  24.38 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  31.1 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  24.38 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2667  hypothetical protein  28.17 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0164697  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  29.8 
 
 		 877 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  31.32 
 
 		 831 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  29.53 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  28.65 
 
 		 909 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  30.65 
 
 		 895 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1214  protein of unknown function DUF403  28.88 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  26.5 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  28.98 
 
 		 818 aa  76.3  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  31.5 
 
 		 890 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12438  hypothetical protein  28.26 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  28.48 
 
 		 878 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  26.2 
 
 		 887 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2197  hypothetical protein  28.85 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507276  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3508  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3580  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3520  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  24.14 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  21.41 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  22.99 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5582  protein of unknown function DUF403  24.76 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  22.32 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  30.91 
 
 		 871 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  21.7 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  24.47 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>