228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2197 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2197  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  636    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507276  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3414  hypothetical protein  40.51 
 
 
314 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  42.14 
 
 
317 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  38.96 
 
 
319 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3275  hypothetical protein  38.51 
 
 
324 aa  222  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000743183  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  38.01 
 
 
321 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  34.82 
 
 
327 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  33.12 
 
 
335 aa  168  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  31.89 
 
 
356 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  34.25 
 
 
357 aa  166  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  33.97 
 
 
324 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  32.62 
 
 
360 aa  165  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  32.32 
 
 
357 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  32.31 
 
 
355 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  33.87 
 
 
318 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  32.3 
 
 
354 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  34.84 
 
 
331 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  34.06 
 
 
329 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  34.58 
 
 
317 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  33.96 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  32.6 
 
 
324 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  32.29 
 
 
324 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  32.91 
 
 
321 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  32.91 
 
 
321 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  29.52 
 
 
313 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  29.52 
 
 
313 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  29.52 
 
 
313 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  31.66 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  30.57 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  32.92 
 
 
322 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  33.54 
 
 
317 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  32.92 
 
 
322 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  31.97 
 
 
319 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  33.65 
 
 
319 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  32.33 
 
 
325 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  30.72 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  28.8 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  31.89 
 
 
324 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  32.09 
 
 
316 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  31.46 
 
 
316 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  31.78 
 
 
316 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  31.13 
 
 
318 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  30.5 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  30.41 
 
 
316 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  31.56 
 
 
318 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  30.41 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  33.54 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  31.03 
 
 
316 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  30.09 
 
 
333 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  31.65 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  29.65 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  29.65 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  31.75 
 
 
315 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17360  hypothetical protein  32.53 
 
 
304 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0522809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  31.23 
 
 
315 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  31.66 
 
 
314 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  31.66 
 
 
314 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  31.15 
 
 
316 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  29.65 
 
 
316 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  30.31 
 
 
316 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5582  protein of unknown function DUF403  28.08 
 
 
313 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  29.17 
 
 
315 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3508  hypothetical protein  33.55 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3580  hypothetical protein  33.55 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3520  hypothetical protein  33.55 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2523  protein of unknown function DUF403  33.85 
 
 
328 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  30.28 
 
 
316 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2906  hypothetical protein  33.85 
 
 
328 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0307  hypothetical protein  32.92 
 
 
310 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.435724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  34.44 
 
 
322 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  31.45 
 
 
314 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  30.82 
 
 
314 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0398  hypothetical protein  28.88 
 
 
332 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2049  protein of unknown function DUF403  31.99 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  29.72 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0774  hypothetical protein  29.63 
 
 
311 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2667  hypothetical protein  31.94 
 
 
324 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0164697  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  29.41 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2099  hypothetical protein  31.31 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3575  hypothetical protein  31.06 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  30.43 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3182  protein of unknown function DUF403  30.34 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  29.52 
 
 
345 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42150  hypothetical protein  30.84 
 
 
317 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  29.87 
 
 
314 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3910  hypothetical protein  32.42 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2798  protein of unknown function DUF403  32.29 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  27.22 
 
 
313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2300  protein of unknown function DUF403  29.72 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0330793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  28.48 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3034  hypothetical protein  32.18 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1214  protein of unknown function DUF403  32.34 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  28.97 
 
 
316 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4572  protein of unknown function DUF403  31.99 
 
 
324 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1013  protein of unknown function DUF403  28.08 
 
 
312 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  28.97 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  28.57 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12438  hypothetical protein  30.6 
 
 
325 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  28.08 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>