222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1743 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  739    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  85.06 
 
 
357 aa  627  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  82.18 
 
 
357 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  74.01 
 
 
354 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  74.64 
 
 
355 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  73.56 
 
 
360 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  46.83 
 
 
335 aa  318  7.999999999999999e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  46.71 
 
 
318 aa  288  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  45.26 
 
 
324 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  44.21 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  43.12 
 
 
321 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  43.12 
 
 
321 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  42.17 
 
 
320 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  40.85 
 
 
334 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  39.18 
 
 
324 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  38.87 
 
 
324 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3275  hypothetical protein  40.29 
 
 
324 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000743183  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  39.88 
 
 
319 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  38.63 
 
 
331 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  39.06 
 
 
313 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  37.89 
 
 
317 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  39.06 
 
 
313 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  39.75 
 
 
333 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  38.75 
 
 
313 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  38.39 
 
 
316 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  38.8 
 
 
315 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  35.8 
 
 
325 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  37.15 
 
 
316 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  37.17 
 
 
322 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  37.69 
 
 
318 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  36.51 
 
 
315 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  38.61 
 
 
319 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  36.53 
 
 
318 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  35.87 
 
 
317 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  37.93 
 
 
320 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  37.14 
 
 
319 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  36.99 
 
 
320 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  35.62 
 
 
316 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  34.89 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  36.19 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3414  hypothetical protein  34.47 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  34.58 
 
 
308 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  35.87 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  35.87 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  34.92 
 
 
316 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  34.77 
 
 
322 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  34.77 
 
 
322 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  35.6 
 
 
324 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  33.53 
 
 
333 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2049  protein of unknown function DUF403  34.3 
 
 
331 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  35.56 
 
 
314 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  34.58 
 
 
316 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  34.57 
 
 
313 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  34.78 
 
 
313 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  34.78 
 
 
313 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  34.38 
 
 
322 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  34.78 
 
 
319 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  32.81 
 
 
313 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  34.98 
 
 
313 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  34.06 
 
 
315 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  34.47 
 
 
313 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  35.86 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  34.78 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  32.81 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  34.47 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  32.81 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  32.81 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  32.81 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  32.81 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  32.81 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  35.24 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  32.71 
 
 
319 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  32.5 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  33.44 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  34.46 
 
 
313 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  32.71 
 
 
319 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  32.5 
 
 
313 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  34.78 
 
 
313 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  35.49 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  32.81 
 
 
316 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  33.96 
 
 
314 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  32.5 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  32.81 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  32.81 
 
 
316 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  34.28 
 
 
316 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  33.66 
 
 
313 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  33.44 
 
 
316 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  35.76 
 
 
314 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  35.76 
 
 
314 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  33.74 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  35.08 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  34.1 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  33.74 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  32.5 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  34.75 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  31.13 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  34.95 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  31.66 
 
 
313 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>