172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2244 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  100 
 
 
333 aa  688    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  36.34 
 
 
335 aa  209  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  33.33 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  35.84 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  34.62 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  34.62 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  34.62 
 
 
313 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  33.53 
 
 
356 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  33.23 
 
 
357 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  37.46 
 
 
318 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  35.53 
 
 
327 aa  186  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  32.83 
 
 
360 aa  186  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  34.87 
 
 
331 aa  186  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  33.65 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  33.03 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  34.67 
 
 
324 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  32.13 
 
 
354 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  33.02 
 
 
320 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  34.19 
 
 
329 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  33.87 
 
 
321 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  33.87 
 
 
321 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  33.44 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  30.4 
 
 
355 aa  172  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  35.23 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  33.33 
 
 
333 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  31.73 
 
 
313 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  30.87 
 
 
313 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  31.73 
 
 
313 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  31.73 
 
 
313 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  31.73 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  31.73 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  31.73 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  31.73 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  31.73 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  31.73 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  32.42 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  32.92 
 
 
315 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  33.23 
 
 
319 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  30.45 
 
 
313 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  31.02 
 
 
321 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  29.81 
 
 
313 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  32.91 
 
 
316 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  32.91 
 
 
316 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  30.45 
 
 
313 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0774  hypothetical protein  31.65 
 
 
311 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  32.37 
 
 
316 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  32.91 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  33.67 
 
 
316 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  33.11 
 
 
316 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  31.63 
 
 
313 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  31.31 
 
 
313 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  31.63 
 
 
313 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  30.99 
 
 
313 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  31.63 
 
 
313 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  30.67 
 
 
313 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  32.82 
 
 
320 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  29.05 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2523  protein of unknown function DUF403  30.6 
 
 
328 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2906  hypothetical protein  30.6 
 
 
328 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  33.11 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  32.31 
 
 
320 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  30.35 
 
 
313 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  32.77 
 
 
314 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  31.65 
 
 
314 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  30.7 
 
 
313 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  33 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  30.82 
 
 
316 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  33.11 
 
 
319 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2470  protein of unknown function DUF403  31.76 
 
 
314 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  30.89 
 
 
324 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  31.44 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  30.27 
 
 
313 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  31.15 
 
 
318 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  31.76 
 
 
314 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  31.31 
 
 
314 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  32.32 
 
 
316 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  31.31 
 
 
314 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  32.46 
 
 
319 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0007  hypothetical protein  29.53 
 
 
314 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.441698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  31.97 
 
 
316 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  32.8 
 
 
322 aa  143  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  31.97 
 
 
316 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  33.66 
 
 
319 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  30.51 
 
 
315 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3100  hypothetical protein  30.7 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.154956  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1675  protein of unknown function DUF403  29.49 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  29.6 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  29.72 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  29.72 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  31.19 
 
 
308 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  30.41 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3034  hypothetical protein  30.57 
 
 
312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  29.97 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0398  hypothetical protein  28.27 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  29.97 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2300  protein of unknown function DUF403  30.6 
 
 
319 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0330793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  29.32 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>