228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1214 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1214  protein of unknown function DUF403  100 
 
 
314 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2667  hypothetical protein  72.2 
 
 
324 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0164697  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3910  hypothetical protein  71.25 
 
 
324 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12438  hypothetical protein  69.33 
 
 
325 aa  441  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3508  hypothetical protein  69.97 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3580  hypothetical protein  69.97 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3520  hypothetical protein  69.97 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2798  protein of unknown function DUF403  65.81 
 
 
327 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3182  protein of unknown function DUF403  64.97 
 
 
325 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2099  hypothetical protein  54.82 
 
 
314 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2204  protein of unknown function DUF403  49.52 
 
 
310 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.878183  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2220  protein of unknown function DUF403  46.62 
 
 
309 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2132  hypothetical protein  46.47 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0017695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1883  protein of unknown function DUF403  45.51 
 
 
308 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4572  protein of unknown function DUF403  38.05 
 
 
324 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17360  hypothetical protein  36.89 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0522809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  33.99 
 
 
319 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  30.98 
 
 
356 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  32.41 
 
 
320 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  29.54 
 
 
354 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  34.29 
 
 
317 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  29.88 
 
 
357 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  30.91 
 
 
329 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  33.44 
 
 
335 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  29.94 
 
 
357 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3275  hypothetical protein  32.67 
 
 
324 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000743183  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  30.25 
 
 
313 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  30.25 
 
 
313 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  29.6 
 
 
360 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  30.25 
 
 
313 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  30.56 
 
 
321 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  30.7 
 
 
321 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  29.36 
 
 
355 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  29.84 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  30.96 
 
 
334 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  31.21 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  31.78 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3414  hypothetical protein  31.31 
 
 
314 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  29.36 
 
 
324 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  28.93 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  28.88 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  33.79 
 
 
333 aa  136  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  31.65 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  29.72 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  30.84 
 
 
320 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  34.14 
 
 
345 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  32.72 
 
 
322 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  29.19 
 
 
320 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3461  hypothetical protein  28.68 
 
 
315 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  30.1 
 
 
313 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1675  protein of unknown function DUF403  32.62 
 
 
315 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1013  protein of unknown function DUF403  30.72 
 
 
312 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0774  hypothetical protein  31.79 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  30.77 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  27.4 
 
 
325 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2906  hypothetical protein  30.97 
 
 
328 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2523  protein of unknown function DUF403  30.97 
 
 
328 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3034  hypothetical protein  31.91 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  31.16 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  27.16 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  29.87 
 
 
333 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  28.62 
 
 
316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  29.14 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0989  hypothetical protein  29.69 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  28.53 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  30.03 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  29.87 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2197  hypothetical protein  32.34 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507276  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  28.62 
 
 
316 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  29.69 
 
 
316 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3100  hypothetical protein  34.96 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.154956  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  28.12 
 
 
317 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  30.42 
 
 
324 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  28.88 
 
 
319 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  28.44 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  29.05 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  27.95 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  28.13 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2049  protein of unknown function DUF403  32.3 
 
 
331 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  27.83 
 
 
313 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  29.06 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  31.69 
 
 
314 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0307  hypothetical protein  32.61 
 
 
310 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.435724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0398  hypothetical protein  30.35 
 
 
332 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  29.07 
 
 
319 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  26.9 
 
 
315 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  29.8 
 
 
316 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  29.01 
 
 
316 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  29.75 
 
 
315 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  30.85 
 
 
316 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  30.15 
 
 
316 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  31.85 
 
 
314 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  28.28 
 
 
316 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  30.53 
 
 
316 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  29.8 
 
 
316 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  30.39 
 
 
314 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  30.39 
 
 
314 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  29.81 
 
 
316 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  29.81 
 
 
316 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>