208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5582 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5582  protein of unknown function DUF403  100 
 
 
313 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  30.63 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  29.81 
 
 
321 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  29.81 
 
 
321 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  29.85 
 
 
355 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  29.97 
 
 
335 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  29.39 
 
 
313 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  29.39 
 
 
313 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  30.28 
 
 
321 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  29.75 
 
 
331 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  29.62 
 
 
319 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  30.31 
 
 
318 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  28.75 
 
 
313 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3414  hypothetical protein  27.48 
 
 
314 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  29.85 
 
 
356 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  29.07 
 
 
327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  28.97 
 
 
324 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  29.65 
 
 
324 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  28.97 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  28.75 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3275  hypothetical protein  29.34 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000743183  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  29.36 
 
 
357 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  28.27 
 
 
360 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0774  hypothetical protein  26.65 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  27.41 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  28.62 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2197  hypothetical protein  28.08 
 
 
313 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507276  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  26.52 
 
 
317 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  30.5 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  30.23 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  28.05 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  31.48 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  27.44 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  27.95 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  26.69 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  27.44 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  27.52 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  26.69 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3461  hypothetical protein  28.96 
 
 
315 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  26.81 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  26.27 
 
 
316 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  25.4 
 
 
313 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2099  hypothetical protein  28.17 
 
 
314 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  26.91 
 
 
345 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  27.3 
 
 
318 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  26.18 
 
 
316 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  27.8 
 
 
315 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  26.18 
 
 
316 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  28.84 
 
 
315 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  28.43 
 
 
319 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  27.06 
 
 
313 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  29.41 
 
 
320 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  27.39 
 
 
319 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  26.12 
 
 
313 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  27.13 
 
 
318 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  28.38 
 
 
308 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  26.74 
 
 
313 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3034  hypothetical protein  26.54 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2204  protein of unknown function DUF403  26.4 
 
 
310 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.878183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  27.57 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  25.85 
 
 
325 aa  99.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  26.45 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2523  protein of unknown function DUF403  27.49 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  25.23 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2906  hypothetical protein  27.49 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  28 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1214  protein of unknown function DUF403  26.53 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  26.42 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  26.42 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  26.42 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  26.33 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2667  hypothetical protein  27.9 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0164697  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  27.33 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  26.38 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0307  hypothetical protein  26.85 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.435724  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  26.88 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  26 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3508  hypothetical protein  26.71 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3580  hypothetical protein  26.71 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  27.18 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  26.79 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3520  hypothetical protein  26.71 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228526 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  26.79 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  26.79 
 
 
343 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  26.26 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  26.88 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4572  protein of unknown function DUF403  28.28 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  26.79 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  26.79 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  26.79 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1013  protein of unknown function DUF403  23.59 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3910  hypothetical protein  27.59 
 
 
324 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  26.6 
 
 
313 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  26.54 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17360  hypothetical protein  25.88 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0522809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  26.37 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  25.72 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  26.71 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>