280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0044 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  55.2 
 
 		 878 aa  917    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  69.69 
 
 		 895 aa  1136    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  44.99 
 
 		 911 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  54.15 
 
 		 887 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  45.31 
 
 		 890 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  100 
 
 		 882 aa  1769    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  53.79 
 
 		 870 aa  896    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  44.29 
 
 		 882 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  44 
 
 		 868 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  43.12 
 
 		 901 aa  621  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  44.3 
 
 		 868 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  43.19 
 
 		 868 aa  611  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  43.45 
 
 		 868 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  43.55 
 
 		 868 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  43.55 
 
 		 868 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  43.55 
 
 		 868 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  39.66 
 
 		 870 aa  602  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  43.14 
 
 		 898 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  43.14 
 
 		 898 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  43.14 
 
 		 898 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  43.14 
 
 		 898 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  43.14 
 
 		 898 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  43.14 
 
 		 898 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  43.14 
 
 		 898 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  40.5 
 
 		 871 aa  566  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  41.52 
 
 		 935 aa  559  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  38.27 
 
 		 839 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  38.3 
 
 		 828 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  40.02 
 
 		 828 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  39.63 
 
 		 832 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  38.09 
 
 		 831 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  39.24 
 
 		 831 aa  482  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  39.11 
 
 		 831 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  35.78 
 
 		 850 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  39.39 
 
 		 832 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  34.62 
 
 		 834 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  40.22 
 
 		 868 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  32.56 
 
 		 853 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  35.08 
 
 		 907 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  36.95 
 
 		 834 aa  422  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  35.23 
 
 		 855 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  32.52 
 
 		 859 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  34.8 
 
 		 855 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  35.49 
 
 		 843 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  34.83 
 
 		 833 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  34.38 
 
 		 844 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  34.17 
 
 		 833 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  33.37 
 
 		 897 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  32.92 
 
 		 805 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  32.89 
 
 		 802 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  32.88 
 
 		 805 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  36.45 
 
 		 839 aa  392  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  36.1 
 
 		 851 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  32.88 
 
 		 833 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  34.34 
 
 		 867 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  34.87 
 
 		 846 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  34.11 
 
 		 846 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  34.99 
 
 		 845 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  30.78 
 
 		 850 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  31.47 
 
 		 804 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  33.42 
 
 		 794 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  33.71 
 
 		 794 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  33.37 
 
 		 794 aa  365  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  34.78 
 
 		 848 aa  363  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  35.24 
 
 		 837 aa  354  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  32.65 
 
 		 845 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  33.66 
 
 		 804 aa  348  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  33.74 
 
 		 835 aa  323  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  30.99 
 
 		 842 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  29.96 
 
 		 884 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  32.61 
 
 		 871 aa  300  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  30.85 
 
 		 877 aa  293  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  30.2 
 
 		 885 aa  290  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  30.2 
 
 		 885 aa  290  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  30.37 
 
 		 885 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  30.91 
 
 		 877 aa  287  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  33.27 
 
 		 480 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  34.78 
 
 		 463 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  34.78 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  35.46 
 
 		 480 aa  268  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  35.28 
 
 		 472 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  33.68 
 
 		 471 aa  263  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  34.39 
 
 		 488 aa  261  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  32.99 
 
 		 471 aa  261  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  32.1 
 
 		 482 aa  259  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  32.85 
 
 		 479 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  32.32 
 
 		 482 aa  259  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  31.5 
 
 		 488 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  32.72 
 
 		 520 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  32.22 
 
 		 479 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  31.07 
 
 		 469 aa  255  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  33.4 
 
 		 488 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  31.92 
 
 		 567 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  31.92 
 
 		 567 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  31.92 
 
 		 567 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  31.61 
 
 		 477 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  33.2 
 
 		 552 aa  254  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  33.77 
 
 		 482 aa  254  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  33.53 
 
 		 507 aa  254  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  31.87 
 
 		 479 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>