294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3861 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  100 
 
 
835 aa  1614    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  49.82 
 
 
848 aa  675    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  43.83 
 
 
871 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  40.62 
 
 
884 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  40.35 
 
 
877 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  40.48 
 
 
885 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  40.48 
 
 
885 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  40.48 
 
 
885 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  40.68 
 
 
877 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  41.48 
 
 
851 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  36.01 
 
 
853 aa  485  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  39.91 
 
 
909 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  33.41 
 
 
859 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  38.28 
 
 
868 aa  439  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  36.71 
 
 
907 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  30.2 
 
 
850 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  37.3 
 
 
839 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  33.77 
 
 
897 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  38.07 
 
 
832 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  40.37 
 
 
828 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  39.95 
 
 
818 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  36.59 
 
 
831 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  36.68 
 
 
831 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  36.78 
 
 
828 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  37.86 
 
 
831 aa  419  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  38.83 
 
 
832 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  34.12 
 
 
804 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  37.48 
 
 
843 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  34.08 
 
 
802 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  35.04 
 
 
850 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  35.6 
 
 
844 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  33.18 
 
 
834 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  34.47 
 
 
839 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  33.79 
 
 
834 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  33.33 
 
 
805 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  33.33 
 
 
805 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  36.54 
 
 
846 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  35.4 
 
 
855 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  35.92 
 
 
794 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  34.14 
 
 
855 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  35.32 
 
 
846 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  36.41 
 
 
867 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  33.14 
 
 
870 aa  379  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  35.52 
 
 
794 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  35.05 
 
 
833 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  35.42 
 
 
794 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  32.93 
 
 
868 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  33.61 
 
 
842 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  32.13 
 
 
878 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  35.5 
 
 
911 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  33.61 
 
 
901 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  34.61 
 
 
833 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  32.81 
 
 
882 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  34.1 
 
 
868 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  35.71 
 
 
833 aa  363  9e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  31.13 
 
 
887 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  33.92 
 
 
882 aa  362  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  33.85 
 
 
868 aa  359  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  36.46 
 
 
845 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  34.15 
 
 
890 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  34.89 
 
 
935 aa  358  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  32.73 
 
 
868 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  37.35 
 
 
837 aa  354  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  35.1 
 
 
898 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  35.1 
 
 
898 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  35.1 
 
 
898 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  35.1 
 
 
898 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  35.1 
 
 
898 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  35.1 
 
 
898 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  35.1 
 
 
898 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  33.84 
 
 
895 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  33.08 
 
 
868 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  30.2 
 
 
870 aa  349  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  32.95 
 
 
868 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  32.95 
 
 
868 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  33.62 
 
 
804 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  32.47 
 
 
871 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  32.87 
 
 
845 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07520  hypothetical protein  34.05 
 
 
737 aa  290  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  32.67 
 
 
857 aa  282  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  33.2 
 
 
606 aa  252  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  33.13 
 
 
553 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  33.19 
 
 
488 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  31.26 
 
 
476 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  31.26 
 
 
471 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  31.26 
 
 
476 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  33.2 
 
 
544 aa  247  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  31.26 
 
 
476 aa  246  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  33.54 
 
 
520 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  35.12 
 
 
526 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  31.48 
 
 
470 aa  245  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  33.33 
 
 
518 aa  244  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  31.05 
 
 
471 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  32.35 
 
 
477 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  30.84 
 
 
476 aa  241  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  32.22 
 
 
519 aa  241  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  33.9 
 
 
553 aa  240  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  30.62 
 
 
471 aa  240  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  34.45 
 
 
507 aa  240  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  31.66 
 
 
489 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>