More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3160 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  47.49 
 
 		 882 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  45.82 
 
 		 935 aa  697    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  49.08 
 
 		 898 aa  760    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  46.62 
 
 		 868 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  43.95 
 
 		 878 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  49.08 
 
 		 898 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  47.31 
 
 		 868 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  42.77 
 
 		 870 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  49.08 
 
 		 898 aa  760    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  47.99 
 
 		 890 aa  717    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  51.87 
 
 		 870 aa  815    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  49.08 
 
 		 898 aa  760    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  48.57 
 
 		 868 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  49.08 
 
 		 898 aa  760    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  54.71 
 
 		 871 aa  885    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  100 
 
 		 901 aa  1826    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  42.92 
 
 		 887 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  43.12 
 
 		 882 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  49.08 
 
 		 898 aa  760    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  46.51 
 
 		 868 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  49.08 
 
 		 898 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  46.8 
 
 		 868 aa  720    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  47.44 
 
 		 868 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  62.2 
 
 		 911 aa  1028    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  46.51 
 
 		 868 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  44.61 
 
 		 895 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  40.31 
 
 		 839 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  39.79 
 
 		 828 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  39.57 
 
 		 868 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  40.74 
 
 		 832 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  42.36 
 
 		 831 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  42.94 
 
 		 828 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  42.44 
 
 		 831 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  40.18 
 
 		 832 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  39.41 
 
 		 831 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  36.85 
 
 		 834 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  37.37 
 
 		 850 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  36.72 
 
 		 855 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  36.79 
 
 		 855 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  36.63 
 
 		 834 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  33.49 
 
 		 850 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  36.22 
 
 		 844 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  36.34 
 
 		 833 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  37.31 
 
 		 833 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  34.43 
 
 		 853 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  36.31 
 
 		 833 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  38 
 
 		 839 aa  452  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  34.85 
 
 		 843 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  34.18 
 
 		 859 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  36.92 
 
 		 907 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  37.07 
 
 		 867 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  36.68 
 
 		 846 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  36.12 
 
 		 846 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  35.09 
 
 		 802 aa  429  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  34.01 
 
 		 805 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  34.15 
 
 		 805 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  35.78 
 
 		 837 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  33.93 
 
 		 804 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  33.14 
 
 		 845 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  33.25 
 
 		 794 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  33.91 
 
 		 845 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  33.12 
 
 		 794 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  37.27 
 
 		 851 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  33.12 
 
 		 794 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  33.33 
 
 		 897 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  34.2 
 
 		 804 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  36.33 
 
 		 848 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  35.33 
 
 		 835 aa  341  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  33.33 
 
 		 871 aa  339  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  31.99 
 
 		 842 aa  333  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  31.76 
 
 		 885 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  31.76 
 
 		 885 aa  329  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  31.76 
 
 		 885 aa  329  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  30.77 
 
 		 884 aa  325  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  30.67 
 
 		 877 aa  321  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  30.9 
 
 		 877 aa  314  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  33.7 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  36.11 
 
 		 552 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  33.92 
 
 		 469 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  30.86 
 
 		 909 aa  303  9e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  37.05 
 
 		 606 aa  302  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  34.58 
 
 		 464 aa  302  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  34.72 
 
 		 486 aa  302  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  35.33 
 
 		 520 aa  301  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  35.85 
 
 		 526 aa  300  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  36.3 
 
 		 518 aa  300  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  35.42 
 
 		 507 aa  299  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  35.08 
 
 		 479 aa  298  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  35.59 
 
 		 544 aa  298  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  36.19 
 
 		 472 aa  297  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  34.63 
 
 		 469 aa  297  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  35.58 
 
 		 463 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  38.53 
 
 		 497 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  34.18 
 
 		 477 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  35.58 
 
 		 472 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  35.28 
 
 		 471 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  35.51 
 
 		 471 aa  295  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  35.28 
 
 		 478 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  35.28 
 
 		 478 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  35.28 
 
 		 477 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>