More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07520  hypothetical protein  100 
 
 		 737 aa  1427    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3770  hypothetical protein  33.29 
 
 		 877 aa  289  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12587  hypothetical protein  32.2 
 
 		 884 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.646817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0165  protein of unknown function DUF404  33.29 
 
 		 848 aa  282  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.089788  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3861  protein of unknown function DUF404  33.67 
 
 		 835 aa  281  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0998608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3333  protein of unknown function DUF404  32.99 
 
 		 871 aa  281  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.55913  decreased coverage  0.00915918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2321  hypothetical protein  33.29 
 
 		 885 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2360  hypothetical protein  33.29 
 
 		 885 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2368  hypothetical protein  33.29 
 
 		 885 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2629  hypothetical protein  33.71 
 
 		 877 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0987  hypothetical protein  27.47 
 
 		 859 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3511  protein of unknown function DUF404  25.57 
 
 		 850 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3098  hypothetical protein  29 
 
 		 853 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.915936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65060  hypothetical protein  30.29 
 
 		 832 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0953  hypothetical protein  29.37 
 
 		 794 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0589  hypothetical protein  29.47 
 
 		 831 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2613  hypothetical protein  29.37 
 
 		 794 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3281  hypothetical protein  27.92 
 
 		 834 aa  219  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4925  hypothetical protein  29.3 
 
 		 831 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3009  hypothetical protein  28.55 
 
 		 839 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2559  hypothetical protein  29.57 
 
 		 907 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3018  hypothetical protein  28.87 
 
 		 794 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278023  normal  0.834834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0542  hypothetical protein  29.19 
 
 		 828 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109218  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0656  hypothetical protein  28.59 
 
 		 828 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.470429  hitchhiker  0.000190393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0394  hypothetical protein  29.46 
 
 		 842 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1064  hypothetical protein  26.67 
 
 		 850 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.801681  normal  0.150534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2248  protein of unknown function DUF404  30.99 
 
 		 857 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.996786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1713  hypothetical protein  28.49 
 
 		 833 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.788939  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2736  hypothetical protein  26.67 
 
 		 802 aa  194  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0856  protein of unknown function DUF404  28.36 
 
 		 804 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319945  normal  0.446218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04330  hypothetical protein  28.55 
 
 		 831 aa  189  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4490  hypothetical protein  26.6 
 
 		 870 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1705  hypothetical protein  28.51 
 
 		 855 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3344  protein of unknown function DUF404  27.64 
 
 		 805 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.550861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3646  protein of unknown function DUF404  27.64 
 
 		 805 aa  180  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3754  hypothetical protein  24.76 
 
 		 804 aa  177  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4274  protein of unknown function DUF404  27.79 
 
 		 833 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3160  hypothetical protein  26.07 
 
 		 901 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4407  protein of unknown function DUF404  25.56 
 
 		 878 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5076  hypothetical protein  28.97 
 
 		 837 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3609  protein of unknown function DUF404  26.83 
 
 		 846 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.956305  normal  0.382472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  27.22 
 
 		 844 aa  158  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1622  hypothetical protein  28.34 
 
 		 845 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5653  hypothetical protein  38.27 
 
 		 832 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1015  protein of unknown function DUF404  39.71 
 
 		 851 aa  151  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3678  protein of unknown function DUF404  34.62 
 
 		 839 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.227774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3584  hypothetical protein  36.71 
 
 		 833 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.260259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3878  protein of unknown function DUF404  38.43 
 
 		 868 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3523  hypothetical protein  35.16 
 
 		 868 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4006  hypothetical protein  35.16 
 
 		 882 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2316  protein of unknown function DUF404  31.76 
 
 		 909 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4111  hypothetical protein  35.81 
 
 		 868 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1965  protein of unknown function DUF404  38.43 
 
 		 818 aa  144  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206535  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1918  u1937b; B1937_F1_4  35.67 
 
 		 868 aa  144  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1932  hypothetical protein  34.84 
 
 		 868 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.86386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4254  hypothetical protein  34.52 
 
 		 868 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0925355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4112  hypothetical protein  34.52 
 
 		 868 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3411  hypothetical protein  34.52 
 
 		 868 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3406  protein of unknown function DUF404  34.04 
 
 		 911 aa  140  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1777  hypothetical protein  34 
 
 		 898 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2056  hypothetical protein  34 
 
 		 898 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0680  hypothetical protein  34 
 
 		 898 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2036  hypothetical protein  34 
 
 		 898 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0879212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1061  hypothetical protein  34 
 
 		 898 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0768  hypothetical protein  34 
 
 		 898 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.777971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1219  hypothetical protein  32.26 
 
 		 870 aa  138  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.663605  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0771  hypothetical protein  34 
 
 		 898 aa  137  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0516  hypothetical protein  36.46 
 
 		 855 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1495  protein of unknown function DUF404  32.66 
 
 		 897 aa  135  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.843051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3032  hypothetical protein  31.73 
 
 		 834 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2638  hypothetical protein  33.94 
 
 		 843 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4759  hypothetical protein  33.45 
 
 		 845 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160273  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0726  hypothetical protein  31.34 
 
 		 887 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  26.71 
 
 		 482 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0044  hypothetical protein  30.77 
 
 		 882 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  30.56 
 
 		 470 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  30.56 
 
 		 470 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2497  hypothetical protein  32.13 
 
 		 871 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3416  hypothetical protein  32.68 
 
 		 867 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  30.22 
 
 		 472 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  30.22 
 
 		 463 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3725  protein of unknown function DUF404  32.68 
 
 		 846 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.139455  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2604  hypothetical protein  32.13 
 
 		 935 aa  122  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  28.52 
 
 		 503 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1668  protein of unknown function DUF404  32.63 
 
 		 508 aa  120  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.325623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  30.28 
 
 		 507 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0068  hypothetical protein  30.86 
 
 		 895 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  28.99 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  27.54 
 
 		 473 aa  119  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  26.81 
 
 		 482 aa  119  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  26.87 
 
 		 482 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  30 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2552  hypothetical protein  31.29 
 
 		 890 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  29.18 
 
 		 492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  27.44 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  30.07 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  30.07 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  30.07 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  31.39 
 
 		 526 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  26.45 
 
 		 482 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>